146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5499 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5499  3-carboxymuconate cyclase-like  100 
 
 
349 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5895  3-carboxymuconate cyclase-like  89.68 
 
 
349 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2182  3-carboxymuconate cyclase-like protein  89.68 
 
 
349 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2199  6-phosphogluconolactonase  88.83 
 
 
348 aa  613  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2221  3-carboxymuconate cyclase-like protein  85.67 
 
 
349 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2099  6-phosphogluconolactonase  85.96 
 
 
349 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1090  6-phosphogluconolactonase  81.66 
 
 
348 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  50.72 
 
 
359 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  37.57 
 
 
386 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  39.31 
 
 
380 aa  220  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  37.28 
 
 
386 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  36.52 
 
 
359 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  35.67 
 
 
377 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  36.81 
 
 
363 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  36.92 
 
 
375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  36.92 
 
 
363 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  35.26 
 
 
367 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  36.07 
 
 
363 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  35.76 
 
 
363 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1974  6-phosphogluconolactonase  38.08 
 
 
340 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.290723  normal  0.0128629 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  31.53 
 
 
331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  31.53 
 
 
331 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  31.53 
 
 
331 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  31.53 
 
 
331 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  31.53 
 
 
331 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  30.97 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2878  6-phosphogluconolactonase  30.14 
 
 
331 aa  162  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  33.24 
 
 
331 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  30.97 
 
 
331 aa  162  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  30.97 
 
 
331 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  30.97 
 
 
331 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  30.97 
 
 
331 aa  161  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  30.97 
 
 
331 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0244  6-phosphogluconolactonase  30.41 
 
 
333 aa  160  3e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  30.55 
 
 
332 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  30.97 
 
 
331 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  30.84 
 
 
332 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  30.97 
 
 
331 aa  159  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  29.26 
 
 
329 aa  150  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  28.82 
 
 
334 aa  136  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  28.53 
 
 
334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  30.51 
 
 
350 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  25.39 
 
 
373 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  27.43 
 
 
385 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  28.02 
 
 
431 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  29.93 
 
 
414 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  31.4 
 
 
411 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  26.84 
 
 
349 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  29.2 
 
 
385 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  27.03 
 
 
370 aa  100  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  30.2 
 
 
414 aa  99.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  30.98 
 
 
411 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  30.98 
 
 
411 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  30.64 
 
 
391 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  30.64 
 
 
411 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  30.64 
 
 
391 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  30.64 
 
 
411 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  30.64 
 
 
391 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  25.64 
 
 
348 aa  96.3  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  28.67 
 
 
415 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  25.25 
 
 
368 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  28.53 
 
 
351 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  28.47 
 
 
376 aa  94  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  30.86 
 
 
351 aa  94  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  27.33 
 
 
412 aa  93.2  6e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  28.33 
 
 
415 aa  92.8  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  29.9 
 
 
415 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  29.9 
 
 
415 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  29.9 
 
 
415 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  28.91 
 
 
375 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  29.18 
 
 
354 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  28.23 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  24.62 
 
 
372 aa  87.8  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  27.92 
 
 
380 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  23.37 
 
 
376 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  26.71 
 
 
414 aa  86.7  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  28.98 
 
 
376 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  29.33 
 
 
388 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  26.09 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  28.29 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  28.61 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  25 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  27.68 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  23.1 
 
 
372 aa  82.8  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  27.83 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  23.17 
 
 
355 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  23.97 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  23.97 
 
 
353 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  26.36 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  27.68 
 
 
388 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  23.42 
 
 
355 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  22.71 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  23.03 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  23.64 
 
 
354 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  24.48 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  22.37 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  29.54 
 
 
380 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  23.1 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  25.36 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  24.23 
 
 
394 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>