197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3411 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  100 
 
 		 354 aa  705    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  47.4 
 
 		 351 aa  285  7e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  49.13 
 
 		 410 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  44.29 
 
 		 414 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  45.38 
 
 		 350 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  47.41 
 
 		 369 aa  262  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  41.72 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  38.78 
 
 		 376 aa  206  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  33.81 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  37.34 
 
 		 412 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  32.38 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  39.36 
 
 		 345 aa  186  7e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  39.61 
 
 		 350 aa  185  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  37.01 
 
 		 348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  41.61 
 
 		 351 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  36.08 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  33.05 
 
 		 373 aa  182  7e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  34.8 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  32.97 
 
 		 368 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  30.35 
 
 		 354 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  30.99 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  30.12 
 
 		 355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  29.91 
 
 		 354 aa  180  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  29.05 
 
 		 354 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  29.58 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  30.12 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  36.29 
 
 		 349 aa  177  4e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  30.11 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  28.97 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  35.55 
 
 		 341 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  37.14 
 
 		 418 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  29.25 
 
 		 355 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  29.51 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  29.59 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  33.24 
 
 		 414 aa  168  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  32.07 
 
 		 375 aa  166  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  31.08 
 
 		 404 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  29.31 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  38.08 
 
 		 351 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  31.32 
 
 		 412 aa  161  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  33.33 
 
 		 388 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  35.14 
 
 		 414 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  34.18 
 
 		 385 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  32.8 
 
 		 388 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  28 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  27.75 
 
 		 374 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  33.23 
 
 		 431 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  32.07 
 
 		 363 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  38.86 
 
 		 353 aa  149  9e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  33.14 
 
 		 385 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  33.03 
 
 		 415 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  33.03 
 
 		 415 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  33.03 
 
 		 415 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  32.23 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.4 
 
 		 415 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  32.16 
 
 		 415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  29.22 
 
 		 342 aa  139  6e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  32.73 
 
 		 411 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  33.03 
 
 		 391 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  33.03 
 
 		 391 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  33.51 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  33.03 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  33.03 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  33.03 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  33.03 
 
 		 411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  30.9 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  30.9 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  32.73 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  29.17 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  29.17 
 
 		 342 aa  136  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  28.99 
 
 		 381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  35.98 
 
 		 379 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  31.45 
 
 		 380 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  31.37 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  28.44 
 
 		 342 aa  129  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  29.66 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  28.69 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2650  3-carboxymuconate cyclase  34.39 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1349  6-phosphogluconolactonase  29.71 
 
 		 340 aa  122  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000593187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  31.06 
 
 		 342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  29.73 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0501  Domain of unknown function DUF2394  34.5 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  30.67 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  33.14 
 
 		 353 aa  116  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  24.07 
 
 		 338 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  27.54 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  32.08 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  30.56 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  31.97 
 
 		 332 aa  114  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  23.28 
 
 		 339 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.46 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  23.28 
 
 		 339 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  32.31 
 
 		 352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.799827 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44009  predicted protein  27.92 
 
 		 526 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.123695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  27.83 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  27.83 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  32.91 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1746  3-carboxymuconate cyclase-like protein  27.36 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00917254  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  28.85 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  28.7 
 
 		 331 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>