138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0501 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0501  Domain of unknown function DUF2394  100 
 
 
365 aa  722    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  47.9 
 
 
353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31940  3-carboxymuconate cyclase  44.23 
 
 
368 aa  237  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0647  Domain of unknown function DUF2394  40 
 
 
366 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0296594  hitchhiker  0.00133017 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  32.95 
 
 
352 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  40.51 
 
 
345 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  34.08 
 
 
355 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  38.66 
 
 
349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  33.71 
 
 
354 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  31.04 
 
 
376 aa  169  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  33.71 
 
 
354 aa  168  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  33.05 
 
 
355 aa  165  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  34.08 
 
 
373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  37.78 
 
 
353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0723  putative secreted protein  39.88 
 
 
365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.780162 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  33.52 
 
 
355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  33.52 
 
 
353 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  34.75 
 
 
348 aa  162  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  32.78 
 
 
355 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2974  hypothetical protein  40.11 
 
 
361 aa  158  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  32.68 
 
 
353 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  32.7 
 
 
412 aa  157  4e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  32.51 
 
 
355 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2754  hypothetical protein  37.43 
 
 
314 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  32.69 
 
 
355 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  32.94 
 
 
372 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  36.83 
 
 
379 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  29.33 
 
 
370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  28.65 
 
 
354 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30.08 
 
 
372 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2089  hypothetical protein  33.07 
 
 
378 aa  138  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  34.8 
 
 
350 aa  138  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  35.76 
 
 
351 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  33.33 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  32.68 
 
 
351 aa  137  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4229  putative secreted protein  36.34 
 
 
340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582834  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  31.62 
 
 
385 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  32.49 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  29.14 
 
 
342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  30.57 
 
 
414 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  32.51 
 
 
348 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  32.98 
 
 
385 aa  129  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  28.81 
 
 
353 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  30.81 
 
 
431 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  31.82 
 
 
418 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  29.12 
 
 
415 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  29.26 
 
 
341 aa  124  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  29.12 
 
 
415 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  29.12 
 
 
415 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  29.66 
 
 
376 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  31.1 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  31.1 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  29.38 
 
 
380 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  31.1 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  31.1 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  31.1 
 
 
411 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  29.53 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  31.1 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  31.1 
 
 
411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  29.1 
 
 
380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  30.83 
 
 
391 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  34.28 
 
 
354 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  28.86 
 
 
338 aa  117  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  29.49 
 
 
376 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001405  hypothetical protein  28.9 
 
 
344 aa  117  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  28 
 
 
368 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  31.28 
 
 
412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  28.37 
 
 
363 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  29.05 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  29.05 
 
 
415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  31.28 
 
 
412 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0481  putative ATP/GTP-binding protein  32.39 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2650  3-carboxymuconate cyclase  32.99 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  27.14 
 
 
338 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  29.51 
 
 
342 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  27.65 
 
 
390 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  27.2 
 
 
391 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  23.6 
 
 
339 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  28.05 
 
 
375 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  29.15 
 
 
381 aa  102  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  27.37 
 
 
394 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  28.78 
 
 
351 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  26.05 
 
 
374 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  28.66 
 
 
404 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  29.79 
 
 
410 aa  99.8  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  23.03 
 
 
339 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  30.66 
 
 
388 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  28.7 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  28.7 
 
 
342 aa  97.4  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  30.57 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  29.03 
 
 
350 aa  97.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  29.23 
 
 
414 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  25.96 
 
 
384 aa  95.1  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3443  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30.93 
 
 
322 aa  94  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  28.23 
 
 
410 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  29.14 
 
 
414 aa  90.1  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  27.3 
 
 
342 aa  89.7  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2973  NHL repeat containing protein  36.12 
 
 
321 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.982781 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  30.39 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  30.62 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.799827 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>