185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2754 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2754  hypothetical protein  100 
 
 
314 aa  620  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  41.89 
 
 
353 aa  192  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  42.4 
 
 
379 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  37.68 
 
 
353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0501  Domain of unknown function DUF2394  37.69 
 
 
365 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0723  putative secreted protein  38.15 
 
 
365 aa  142  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.780162 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  35.19 
 
 
368 aa  135  7.000000000000001e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0481  putative ATP/GTP-binding protein  34.38 
 
 
356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4229  putative secreted protein  36.55 
 
 
340 aa  132  7.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582834  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  31.83 
 
 
373 aa  128  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  39.41 
 
 
345 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31940  3-carboxymuconate cyclase  36.26 
 
 
368 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  31.29 
 
 
353 aa  119  9e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  34.59 
 
 
361 aa  117  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  34.81 
 
 
351 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  36.15 
 
 
348 aa  116  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  32.82 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  31.82 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0647  Domain of unknown function DUF2394  35.28 
 
 
366 aa  112  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0296594  hitchhiker  0.00133017 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  33.53 
 
 
349 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  31.73 
 
 
350 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  29.39 
 
 
372 aa  105  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  27.99 
 
 
352 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  33.15 
 
 
418 aa  103  4e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2650  3-carboxymuconate cyclase  33.56 
 
 
328 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  31.04 
 
 
412 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  28.99 
 
 
354 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  31.56 
 
 
363 aa  101  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  32 
 
 
414 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  29.1 
 
 
385 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  30.95 
 
 
380 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30.16 
 
 
372 aa  99.8  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  28.32 
 
 
374 aa  99.8  6e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  29.46 
 
 
355 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  30.95 
 
 
376 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001405  hypothetical protein  30.32 
 
 
344 aa  99.4  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  29.85 
 
 
376 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  31.32 
 
 
348 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  28.92 
 
 
354 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2974  hypothetical protein  34.39 
 
 
361 aa  97.8  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  29.79 
 
 
380 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  28.88 
 
 
355 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  32.56 
 
 
415 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  32.56 
 
 
415 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.56 
 
 
415 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24050  3-carboxymuconate cyclase  30.5 
 
 
354 aa  96.7  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  28.77 
 
 
355 aa  95.9  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  28.77 
 
 
353 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  31.25 
 
 
412 aa  95.9  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  30.42 
 
 
350 aa  95.9  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  29.26 
 
 
355 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  30.5 
 
 
375 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  26.18 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  33.88 
 
 
391 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  33.88 
 
 
391 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  33.88 
 
 
391 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  33.88 
 
 
411 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  32.78 
 
 
411 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  33.88 
 
 
411 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1349  6-phosphogluconolactonase  25.99 
 
 
340 aa  94  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000593187  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  29.61 
 
 
431 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  33.55 
 
 
411 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  33.55 
 
 
411 aa  93.6  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  32.22 
 
 
414 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  32.42 
 
 
385 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  32.61 
 
 
354 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  32.38 
 
 
415 aa  92.4  8e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  27.95 
 
 
353 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  28.04 
 
 
355 aa  92  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  25.98 
 
 
370 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  27.69 
 
 
355 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.06 
 
 
415 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  31.99 
 
 
351 aa  87.8  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  27.33 
 
 
341 aa  87.8  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  29.41 
 
 
376 aa  87.4  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  29.28 
 
 
414 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  26.86 
 
 
354 aa  85.5  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  31.8 
 
 
410 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  23.1 
 
 
339 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  25.79 
 
 
342 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  27.79 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  26.69 
 
 
381 aa  80.5  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  26.5 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3443  3-carboxymuconate cyclase-like protein  31.34 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  28.29 
 
 
384 aa  78.6  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44009  predicted protein  26.19 
 
 
526 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.123695  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1746  3-carboxymuconate cyclase-like protein  25.17 
 
 
328 aa  76.3  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00917254  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  29.04 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  27.73 
 
 
390 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  26.47 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  24.56 
 
 
338 aa  74.3  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  31.92 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  29.7 
 
 
388 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  27.35 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  28.57 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  29.04 
 
 
388 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  26.81 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  26.65 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  26.65 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  28.49 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0539919 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>