104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3443 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3443  3-carboxymuconate cyclase-like protein  100 
 
 		 322 aa  643    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  31.72 
 
 		 353 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  24.68 
 
 		 355 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0501  Domain of unknown function DUF2394  30.93 
 
 		 365 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  33.57 
 
 		 361 aa  97.4  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  29 
 
 		 351 aa  92.4  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  24.92 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  25.56 
 
 		 355 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  25.56 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  23.72 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  23.4 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  24.6 
 
 		 355 aa  90.5  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  33.08 
 
 		 353 aa  89.4  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  26.1 
 
 		 411 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  25.73 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  24.04 
 
 		 355 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  24.34 
 
 		 338 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  27.78 
 
 		 391 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  24.61 
 
 		 376 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  26.27 
 
 		 414 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  27.49 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  27.49 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  27.49 
 
 		 411 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  27.49 
 
 		 411 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  27.49 
 
 		 411 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  27.49 
 
 		 411 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  26.13 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  24.04 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  25.87 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  24.04 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  25.22 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  25.22 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  25.22 
 
 		 415 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2754  hypothetical protein  31.34 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113046 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  22.26 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  27.35 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  27.21 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  27.59 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  26.73 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  28.73 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  31.95 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  23.87 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  27.54 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  28.96 
 
 		 345 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  27.54 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  24.47 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  25 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  26.51 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  27.76 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  26.81 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  26.39 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31940  3-carboxymuconate cyclase  29.32 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  24.19 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  25.25 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1746  3-carboxymuconate cyclase-like protein  26.12 
 
 		 328 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00917254  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  26.97 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4229  putative secreted protein  28.98 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.582834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  22.77 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  24.31 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2974  hypothetical protein  30.36 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  23.26 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  25.17 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  23.62 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0723  putative secreted protein  27.1 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.780162 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  26.22 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  30.89 
 
 		 412 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  24.44 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  26.22 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  24.85 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001405  hypothetical protein  27.53 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  26.87 
 
 		 348 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  27.94 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  23.4 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  25 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  30.58 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  22.29 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  28.32 
 
 		 350 aa  63.5  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  29.2 
 
 		 332 aa  63.2  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  25.24 
 
 		 348 aa  62.4  0.000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  23.58 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  23.58 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  23.87 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  25.82 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  26.24 
 
 		 376 aa  60.1  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  28.44 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  25.23 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  26.79 
 
 		 351 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2650  3-carboxymuconate cyclase  27.97 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  26.16 
 
 		 369 aa  53.1  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  29.15 
 
 		 388 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  29.96 
 
 		 418 aa  52.8  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  25.79 
 
 		 388 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0647  Domain of unknown function DUF2394  27.21 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0296594  hitchhiker  0.00133017 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24050  3-carboxymuconate cyclase  25.51 
 
 		 354 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  24.91 
 
 		 414 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  25.16 
 
 		 342 aa  47.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0481  putative ATP/GTP-binding protein  25.69 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01440  expressed protein  26.06 
 
 		 375 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44009  predicted protein  23.01 
 
 		 526 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.123695  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1349  6-phosphogluconolactonase  24.45 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000593187  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>