167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0049 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  100 
 
 		 418 aa  841    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  79.42 
 
 		 412 aa  681    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  78.64 
 
 		 412 aa  669    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  36.93 
 
 		 376 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  36.56 
 
 		 414 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  32.97 
 
 		 354 aa  206  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 354 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  35.48 
 
 		 373 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  32.88 
 
 		 355 aa  203  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  37.23 
 
 		 350 aa  200  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  33.51 
 
 		 404 aa  200  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  38.24 
 
 		 350 aa  199  5e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  38.6 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  33.24 
 
 		 376 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  33.15 
 
 		 355 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  33.15 
 
 		 353 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  35.6 
 
 		 351 aa  196  8.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  32.33 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  32.43 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  37.1 
 
 		 349 aa  194  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  32.97 
 
 		 355 aa  193  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  32.43 
 
 		 355 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  31.6 
 
 		 414 aa  189  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  34.15 
 
 		 353 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  31.78 
 
 		 355 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  34.74 
 
 		 368 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  34.3 
 
 		 363 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  34.24 
 
 		 385 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  33.42 
 
 		 412 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  29.59 
 
 		 354 aa  176  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  34.4 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  33.42 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  32.88 
 
 		 348 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  37.14 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  30.15 
 
 		 352 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  32.58 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  31.88 
 
 		 370 aa  168  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  30.59 
 
 		 372 aa  168  2e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  36.02 
 
 		 351 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30.98 
 
 		 372 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  31.06 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  31.92 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  31.29 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  32.58 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  31.92 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  31.29 
 
 		 411 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  32.58 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  31.65 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4552  putative hemagglutinin-related protein  34.72 
 
 		 369 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.846091  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  32.04 
 
 		 381 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  32.47 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.47 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  32.47 
 
 		 415 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  35.2 
 
 		 391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  33.88 
 
 		 353 aa  156  8e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  36.14 
 
 		 345 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  34.67 
 
 		 379 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  32.18 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  31.9 
 
 		 415 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  31.03 
 
 		 414 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  29.35 
 
 		 394 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  31.56 
 
 		 414 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  29.97 
 
 		 390 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  33.78 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  33.43 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  33.12 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  32.79 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  30.86 
 
 		 380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  28.98 
 
 		 384 aa  140  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  29.83 
 
 		 375 aa  139  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  31.05 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  26.98 
 
 		 374 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  31.87 
 
 		 376 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  31.87 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2650  3-carboxymuconate cyclase  31.85 
 
 		 328 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0578  6-phosphogluconolactonase  27.76 
 
 		 342 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  29.43 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1978  hypothetical protein  29.21 
 
 		 342 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0536257  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2011  hypothetical protein  29.21 
 
 		 342 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  29.26 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  27.13 
 
 		 342 aa  122  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  27.38 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  30.72 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0501  Domain of unknown function DUF2394  32.3 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  31.3 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  24.66 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  32.82 
 
 		 361 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0723  putative secreted protein  33.03 
 
 		 365 aa  113  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.780162 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  25.2 
 
 		 339 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0647  Domain of unknown function DUF2394  40.29 
 
 		 366 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0296594  hitchhiker  0.00133017 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  33.12 
 
 		 375 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  29.33 
 
 		 342 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  33.12 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  32.9 
 
 		 363 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  34.04 
 
 		 363 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  29.93 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  29.8 
 
 		 332 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  29.93 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2754  hypothetical protein  33.15 
 
 		 314 aa  103  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  28.35 
 
 		 377 aa  103  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>