170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1746 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1746  3-carboxymuconate cyclase-like protein  100 
 
 		 328 aa  679    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00917254  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0161  YkgB  85.26 
 
 		 100 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  28.74 
 
 		 351 aa  129  9.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  30.58 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  29.28 
 
 		 372 aa  125  9e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  28.43 
 
 		 352 aa  123  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  28.87 
 
 		 355 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  28.87 
 
 		 353 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  28.87 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  28.18 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  28.52 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  28.03 
 
 		 354 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  27.84 
 
 		 355 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  27.84 
 
 		 353 aa  116  5e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  27.93 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  27.59 
 
 		 354 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  26.91 
 
 		 350 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  25.9 
 
 		 372 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  28.41 
 
 		 351 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  27.36 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  26.17 
 
 		 380 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3976  hypothetical protein  26.97 
 
 		 353 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  26.02 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  28.68 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  28.66 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  28.12 
 
 		 376 aa  99.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  25.24 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  27.56 
 
 		 376 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  24.16 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  29.05 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  24.28 
 
 		 353 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001405  hypothetical protein  28.24 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  23.87 
 
 		 338 aa  96.3  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  26.15 
 
 		 363 aa  95.9  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  24 
 
 		 373 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  25.98 
 
 		 351 aa  95.5  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  25.5 
 
 		 376 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  26.01 
 
 		 380 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  28 
 
 		 350 aa  92.8  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1585  hypothetical protein  29.02 
 
 		 345 aa  92.4  9e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1349  6-phosphogluconolactonase  25.09 
 
 		 340 aa  92.4  9e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000593187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3701  6-phosphogluconolactonase  26.38 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2456  hypothetical protein  23.19 
 
 		 341 aa  91.7  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000113329  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2650  3-carboxymuconate cyclase  24.92 
 
 		 328 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.547089  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0049  putative hemaggltinin-related protein  26.38 
 
 		 418 aa  91.3  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2566  hypothetical protein  24.57 
 
 		 332 aa  91.7  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225442  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  25.66 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3378  putative hemaggltinin-related protein  25.98 
 
 		 412 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1457  hypothetical protein  27.19 
 
 		 342 aa  90.9  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0718826  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  26.12 
 
 		 414 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  25.95 
 
 		 375 aa  89.7  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  24.19 
 
 		 381 aa  89.7  7e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  27.97 
 
 		 388 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  24.85 
 
 		 349 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2315  putative secreted protein  27.27 
 
 		 353 aa  88.6  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0946326  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  24.38 
 
 		 394 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  25.41 
 
 		 411 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  25.48 
 
 		 342 aa  87  4e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  27.2 
 
 		 388 aa  87  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  28.32 
 
 		 414 aa  86.7  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  24.53 
 
 		 414 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2379  6-phosphogluconolactonase  26.54 
 
 		 352 aa  86.3  7e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.799827 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  25.26 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  25.59 
 
 		 339 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  25.25 
 
 		 339 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  25.26 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  25.2 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  25.26 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  23.84 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  24.13 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  25.87 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  23.84 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  24.13 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5389  3-carboxymuconate cyclase-like protein  25.16 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  23.91 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  24.6 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  23.91 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  26 
 
 		 410 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  22.35 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  24.45 
 
 		 331 aa  83.6  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  24.45 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  23.75 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  24.45 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  24.45 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  24.45 
 
 		 331 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3595  hypothetical protein  25.4 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  24.45 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  25.68 
 
 		 385 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  25.97 
 
 		 391 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  24.45 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  26.07 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  23.5 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  23.5 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  23.5 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  23.5 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  25.77 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  25.77 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0481  putative ATP/GTP-binding protein  27.43 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  23.5 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  24.57 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>