33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0161 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0161  YkgB  100 
 
 		 100 aa  206  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1746  3-carboxymuconate cyclase-like protein  85.26 
 
 		 328 aa  165  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00917254  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001405  hypothetical protein  38.57 
 
 		 344 aa  53.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0768  3-carboxymuconate cyclase-like protein  31.63 
 
 		 338 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00750799  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  34.21 
 
 		 351 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  31.82 
 
 		 351 aa  48.9  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 		 370 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2410  6-phosphogluconolactonase  36.23 
 
 		 352 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.687945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  32.58 
 
 		 354 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  34.62 
 
 		 386 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3176  hypothetical protein  38.33 
 
 		 355 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3396  hypothetical protein  38.33 
 
 		 354 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  32.58 
 
 		 355 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  38.33 
 
 		 355 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3077  hypothetical protein  38.33 
 
 		 354 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3427  hypothetical protein  38.33 
 
 		 353 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  35 
 
 		 353 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  32.65 
 
 		 412 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  38.33 
 
 		 355 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  36.67 
 
 		 355 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  35 
 
 		 355 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB03720  expressed protein  32.56 
 
 		 375 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.385161  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 		 386 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  30.61 
 
 		 372 aa  43.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  29.59 
 
 		 376 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  36.07 
 
 		 372 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01440  expressed protein  43.24 
 
 		 375 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  33.33 
 
 		 339 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  29.21 
 
 		 388 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  39.34 
 
 		 339 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  27.96 
 
 		 348 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  32.79 
 
 		 338 aa  41.2  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06344  6-phosphogluconolactonase  33.33 
 
 		 348 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>