184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2765 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  730    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  91.9 
 
 		 377 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  43.98 
 
 		 380 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  41.34 
 
 		 386 aa  293  2e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  41.62 
 
 		 386 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  38.03 
 
 		 375 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  38.03 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  37.78 
 
 		 363 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  37.78 
 
 		 363 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  36.8 
 
 		 363 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  33.98 
 
 		 367 aa  215  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5499  3-carboxymuconate cyclase-like  36.52 
 
 		 349 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5895  3-carboxymuconate cyclase-like  35.71 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2221  3-carboxymuconate cyclase-like protein  35.33 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2182  3-carboxymuconate cyclase-like protein  35.71 
 
 		 349 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  33.81 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2099  6-phosphogluconolactonase  34.55 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  35.33 
 
 		 359 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  33.14 
 
 		 332 aa  179  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2199  6-phosphogluconolactonase  34.29 
 
 		 348 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  32.66 
 
 		 332 aa  175  9e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2878  6-phosphogluconolactonase  31.81 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  30.64 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  31.32 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  31.32 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  32.95 
 
 		 329 aa  169  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0244  6-phosphogluconolactonase  28.77 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1090  6-phosphogluconolactonase  33.24 
 
 		 348 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  30.35 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  30.35 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  30.35 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  30.35 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  30.35 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  29.77 
 
 		 331 aa  159  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  29.77 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  29.77 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  30.99 
 
 		 376 aa  158  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  29.77 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  29.77 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  29.77 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  29.48 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  30.37 
 
 		 412 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1974  6-phosphogluconolactonase  29.86 
 
 		 340 aa  149  8e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.290723  normal  0.0128629 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  30.1 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  29.41 
 
 		 373 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6877  6-phosphogluconolactonase  30.21 
 
 		 414 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0754245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6187  6-phosphogluconolactonase  30.9 
 
 		 350 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  30.75 
 
 		 349 aa  139  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  29.89 
 
 		 388 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  32.3 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  30.37 
 
 		 363 aa  133  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  30.09 
 
 		 410 aa  133  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  28.44 
 
 		 376 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  28.74 
 
 		 388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  27.08 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  28.14 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  25.8 
 
 		 353 aa  126  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  29.71 
 
 		 384 aa  125  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1553  hypothetical protein  30.66 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574544 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  27.08 
 
 		 370 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  30.09 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  28.94 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  26.5 
 
 		 390 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  26.36 
 
 		 381 aa  119  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  28.4 
 
 		 376 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  26.88 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  30.45 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  25.93 
 
 		 394 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  26.59 
 
 		 411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  26.59 
 
 		 411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  26.59 
 
 		 391 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  26.59 
 
 		 411 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  26.59 
 
 		 391 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  26.59 
 
 		 411 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  26.59 
 
 		 391 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  23.85 
 
 		 354 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  28.12 
 
 		 385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  27.59 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  27.03 
 
 		 368 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3874  putative hemagglutinin-related protein  28.49 
 
 		 351 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.978185  normal  0.726778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  32.08 
 
 		 351 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  24.65 
 
 		 414 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  27.38 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  26.91 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  27.94 
 
 		 431 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3408  hypothetical protein  26.88 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  24.86 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  30.59 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  26.2 
 
 		 415 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  26.2 
 
 		 415 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  26.2 
 
 		 415 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  24.86 
 
 		 415 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  23.95 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  25.36 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  22.82 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  24.92 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  23.35 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3160  hypothetical protein  23.42 
 
 		 355 aa  99.4  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  23.72 
 
 		 355 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  25.47 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>