151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2221 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2221  3-carboxymuconate cyclase-like protein  100 
 
 		 349 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2099  6-phosphogluconolactonase  95.7 
 
 		 349 aa  660    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5499  3-carboxymuconate cyclase-like  85.67 
 
 		 349 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5895  3-carboxymuconate cyclase-like  85.1 
 
 		 349 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2182  3-carboxymuconate cyclase-like protein  85.1 
 
 		 349 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2199  6-phosphogluconolactonase  84.24 
 
 		 348 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1090  6-phosphogluconolactonase  81.95 
 
 		 348 aa  541  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6529  6-phosphogluconolactonase  48.7 
 
 		 359 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111343  normal  0.102663 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3325  6-phosphogluconolactonase  37.57 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3481  6-phosphogluconolactonase  37.86 
 
 		 386 aa  226  6e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2830  6-phosphogluconolactonase  39.02 
 
 		 380 aa  224  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.382874  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1718  6-phosphogluconolactonase  37.21 
 
 		 363 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.042506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2494  hypothetical protein  35.61 
 
 		 377 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2765  hypothetical protein  35.33 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.122713  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6297  hypothetical protein  35.55 
 
 		 367 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5660  3-carboxymuconate cyclase-like  38.3 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626662  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6025  3-carboxymuconate cyclase-like protein  38.3 
 
 		 363 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5886  6-phosphogluconolactonase  37.75 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6126  hypothetical protein  37.39 
 
 		 363 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.010909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1974  6-phosphogluconolactonase  36.73 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.290723  normal  0.0128629 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1307  6-phosphogluconolactonase  33.14 
 
 		 331 aa  163  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1258  6-phosphogluconolactonase  30.97 
 
 		 331 aa  162  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0790  6-phosphogluconolactonase  30.68 
 
 		 331 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.971617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0935  6-phosphogluconolactonase  31.25 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0912  6-phosphogluconolactonase  31.25 
 
 		 331 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0821  6-phosphogluconolactonase  31.25 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.609768  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0880  6-phosphogluconolactonase  31.25 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0849  6-phosphogluconolactonase  31.25 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2875  6-phosphogluconolactonase  30.68 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192963  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2878  6-phosphogluconolactonase  30.72 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0821  6-phosphogluconolactonase  30.68 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0794  6-phosphogluconolactonase  30.68 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2895  6-phosphogluconolactonase  30.68 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0212096  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0870  6-phosphogluconolactonase  30.68 
 
 		 331 aa  159  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.923761 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2591  6-phosphogluconolactonase  30.68 
 
 		 331 aa  159  9e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0244  6-phosphogluconolactonase  29.24 
 
 		 333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1280  6-phosphogluconolactonase  30.32 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3051  6-phosphogluconolactonase  30.23 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1181  6-phosphogluconolactonase  30.37 
 
 		 329 aa  142  7e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2846  6-phosphogluconolactonase  29.97 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2933  6-phosphogluconolactonase  29.97 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4427  6-phosphogluconolactonase  29.91 
 
 		 350 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.162495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5727  6-phosphogluconolactonase  24.6 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0610515 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2636  6-phosphogluconolactonase  28.49 
 
 		 349 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4202  6-phosphogluconolactonase  27.37 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0955  6-phosphogluconolactonase  28.82 
 
 		 414 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0975  hypothetical protein  29.93 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3304  hypothetical protein  27.76 
 
 		 385 aa  99.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2451  6-phosphogluconolactonase  28.17 
 
 		 370 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1242  6-phosphogluconolactonase  27.14 
 
 		 431 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5664  3-carboxymuconate cyclase-like  28.91 
 
 		 414 aa  97.4  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1341  YkgB  30.07 
 
 		 411 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1710  3-carboxymuconate cyclase-like  28.74 
 
 		 415 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.446688  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2322  3-carboxymuconate cyclase-like protein  28.74 
 
 		 415 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.400983  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1030  hypothetical protein  29.72 
 
 		 391 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1183  hypothetical protein  30.07 
 
 		 411 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0313  hypothetical protein  29.72 
 
 		 391 aa  95.9  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2345  6-phosphogluconolactonase  28.74 
 
 		 415 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361508  normal  0.056194 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1926  hypothetical protein  29.72 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.012606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0837  hypothetical protein  29.72 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1191  hypothetical protein  29.72 
 
 		 391 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333558  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2090  6-phosphogluconolactonase  30.91 
 
 		 385 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0876592 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2361  3-carboxymuconate cyclase-like protein  28.81 
 
 		 415 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.882801  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2241  6-phosphogluconolactonase  28.96 
 
 		 415 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.695665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2139  6-phosphogluconolactonase  27.46 
 
 		 376 aa  92.8  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3105  6-phosphogluconolactonase  25.17 
 
 		 368 aa  92.4  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000219281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27450  3-carboxymuconate cyclase  28.66 
 
 		 363 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97504  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5526  6-phosphogluconolactonase  29.88 
 
 		 375 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.621516  normal  0.465455 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4109  6-phosphogluconolactonase  30.62 
 
 		 351 aa  89.7  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2467  hypothetical protein  28.53 
 
 		 351 aa  89.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1157  3-carboxymuconate cyclase  25.99 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1446  hypothetical protein  26.51 
 
 		 372 aa  87.8  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3679  6-phosphogluconolactonase  27.11 
 
 		 412 aa  85.9  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04695  putative hemagglutinin-related protein  29.32 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.135652  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0497  3-carboxymuconate cyclase-like protein  24.67 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0750  6-phosphogluconolactonase  24.53 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3511  6-phosphogluconolactonase  24.26 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0324444  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0130  putative 6-phosphogluconolactonase  24.75 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0539919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09550  hypothetical protein  29.84 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3768  hypothetical protein  27.1 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1581  6-phosphogluconolactonase  28.21 
 
 		 376 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0171669 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3411  putative hemagglutinin-related protein  28.62 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108111 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1712  hypothetical protein  26.05 
 
 		 394 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2435  6-phosphogluconolactonase  24.74 
 
 		 353 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0432  putative cycloisomerase  24.84 
 
 		 381 aa  77.4  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3721  hypothetical protein  27.01 
 
 		 380 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.324641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0656  3-carboxymuconate cyclase  29.55 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.702044  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4373  6-phosphogluconolactonase  24.49 
 
 		 404 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.432852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2021  hypothetical protein  27.01 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0450  6-phosphogluconolactonase  25.85 
 
 		 384 aa  75.9  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3222  hypothetical protein  32.16 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.545614  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3924  hypothetical protein  26.41 
 
 		 410 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.219739 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3101  6-phosphogluconolactonase  22.05 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0894  hypothetical protein  27.88 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.503545  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3383  6-phosphogluconolactonase  22.33 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1232  hypothetical protein  25.21 
 
 		 339 aa  73.2  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0395677  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4700  6-phosphogluconolactonase  24.89 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1041  hypothetical protein  26.73 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00230518  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3406  hypothetical protein  22.51 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682955  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1848  hypothetical protein  21.36 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>