26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3038 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3038  hypothetical protein  100 
 
 		 570 aa  1122    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2089  hypothetical protein  45.76 
 
 		 850 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0764  hypothetical protein  43.75 
 
 		 769 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.757577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1066  hypothetical protein  42.41 
 
 		 912 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5957  putative lipoprotein  35.81 
 
 		 682 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.748693  normal  0.687 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0101  putative lipoprotein transmembrane  48.81 
 
 		 120 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.760048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05624  hypothetical protein  28.57 
 
 		 3146 aa  63.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0948  hypothetical protein  32.54 
 
 		 582 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  41.98 
 
 		 521 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  41.98 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0127  putative hemagglutinin-related protein  42.68 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01887  putative hemagglutinin-related protein  42.7 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0897  hypothetical protein  34.58 
 
 		 575 aa  60.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.384975  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3650  putative lipoprotein transmembrane  43.02 
 
 		 119 aa  60.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3327  putative lipoprotein transmembrane  41.86 
 
 		 119 aa  60.5  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  50 
 
 		 688 aa  57.4  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3152  hypothetical protein  29.38 
 
 		 315 aa  57  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.918105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0768  hypothetical protein  32.89 
 
 		 385 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1162  hypothetical protein  29.82 
 
 		 435 aa  50.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.815889  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000456  hypothetical protein  26.57 
 
 		 3470 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0467  hypothetical protein  37.63 
 
 		 655 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4328  cadherin domain-containing protein  34.66 
 
 		 2193 aa  48.9  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.859375  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0757  hypothetical protein  30.7 
 
 		 386 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00827619  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  32.68 
 
 		 296 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0375  putative lipoprotein  28.46 
 
 		 670 aa  43.9  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0939626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2452  hypothetical protein  32.97 
 
 		 539 aa  43.5  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0816235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>