More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1426 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 473 aa  926    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  52.47 
 
 		 842 aa  130  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0643  haemagluttinin family protein  51.2 
 
 		 1122 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.696074  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1590  haemagluttinin family protein  51.2 
 
 		 1122 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0840  haemagluttinin family protein  51.2 
 
 		 1090 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1750  haemagluttinin family protein  51.2 
 
 		 1074 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1565  haemagluttinin family protein  51.2 
 
 		 1122 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0513  haemagluttinin family protein  51.2 
 
 		 1090 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.421174  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1361  haemagluttinin family protein  51.2 
 
 		 1090 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  54.19 
 
 		 1451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  52.8 
 
 		 1147 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  57.24 
 
 		 512 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  53.12 
 
 		 1168 aa  123  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  52.9 
 
 		 936 aa  123  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  52.8 
 
 		 712 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  53.64 
 
 		 748 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  52.6 
 
 		 643 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  52.53 
 
 		 585 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  52.94 
 
 		 813 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  48.72 
 
 		 462 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5846  YadA-like protein  37.3 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  48.75 
 
 		 2914 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  50.65 
 
 		 382 aa  114  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  48.28 
 
 		 838 aa  113  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.06 
 
 		 689 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  46.59 
 
 		 951 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  50 
 
 		 835 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  47.88 
 
 		 442 aa  111  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  49.32 
 
 		 298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  48.68 
 
 		 459 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  46.52 
 
 		 835 aa  111  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  49.02 
 
 		 1170 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  49.67 
 
 		 1321 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  46.24 
 
 		 706 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  45.56 
 
 		 582 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  44.09 
 
 		 934 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  45.98 
 
 		 867 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  44.37 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  51.68 
 
 		 1297 aa  108  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  45.28 
 
 		 319 aa  106  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2908  putative haemagglutinin  38.26 
 
 		 3192 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  45.29 
 
 		 835 aa  104  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6868  Haemagluttinin domain protein  37.98 
 
 		 2832 aa  103  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.587057 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  41.03 
 
 		 492 aa  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  50.66 
 
 		 474 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  46 
 
 		 2851 aa  103  8e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2229  Hep_Hag family protein  35.66 
 
 		 1068 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1027  outer membrane protein, putative  35.66 
 
 		 1012 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  46.41 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  52.05 
 
 		 523 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  46.1 
 
 		 815 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  49.66 
 
 		 307 aa  102  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2027  putative outer membrane protein  35.66 
 
 		 962 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.782084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  46.15 
 
 		 835 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2083  putative outer membrane protein  35.66 
 
 		 1186 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.345097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  46.88 
 
 		 1055 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  43.79 
 
 		 466 aa  99.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  46.36 
 
 		 468 aa  99.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  44.12 
 
 		 493 aa  99.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  44.58 
 
 		 478 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  38.31 
 
 		 344 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3834  YadA domain-containing protein  35.98 
 
 		 536 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.466914  normal  0.508963 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  47.74 
 
 		 1219 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  43.75 
 
 		 645 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  44.09 
 
 		 400 aa  97.4  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0878  hemagglutinin domain-containing protein  37.99 
 
 		 525 aa  97.1  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0582  haemagluttinin family protein  48.7 
 
 		 820 aa  96.7  8e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1650  hemagglutination repeat-containing protein  37.82 
 
 		 880 aa  96.7  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1320  haemagluttinin family protein  48.7 
 
 		 816 aa  96.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1247  haemagluttinin family protein  48.7 
 
 		 816 aa  96.7  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.735961  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0306  haemagluttinin family protein  48.7 
 
 		 816 aa  96.7  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.700295  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0985  haemagluttinin family protein  48.7 
 
 		 816 aa  96.7  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.205403  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1487  YadA domain-containing protein  35.75 
 
 		 472 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.693194  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1324  haemagluttinin family protein  48.7 
 
 		 831 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0293866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2506  haemagluttinin family protein  48.7 
 
 		 831 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1489  Hep_Hag family protein  48.05 
 
 		 831 aa  96.3  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  45.52 
 
 		 300 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3524  YadA domain-containing protein  40.54 
 
 		 330 aa  95.5  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1400  putative adhesin  45.7 
 
 		 1916 aa  94.7  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  47.89 
 
 		 481 aa  94.4  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1761  YadA domain-containing protein  36.54 
 
 		 876 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3522  hemagluttinin domain-containing protein  44.57 
 
 		 1487 aa  94  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  45.27 
 
 		 252 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5212  YadA domain-containing protein  34.48 
 
 		 575 aa  93.6  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.146936 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  45.03 
 
 		 587 aa  93.6  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  49.01 
 
 		 380 aa  93.2  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02671  adhesin-like protein A  35.04 
 
 		 1265 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03061  adhesin-like protein B  31.92 
 
 		 989 aa  92.8  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  37.14 
 
 		 524 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3524  hemagglutination repeat-containing protein  36.6 
 
 		 878 aa  92.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.20838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2621  YadA domain protein  40.36 
 
 		 877 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.171767  normal  0.911362 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2883  YadA domain-containing protein  37.25 
 
 		 597 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4223  YadA domain-containing protein  47.01 
 
 		 1613 aa  90.9  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.551449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2268  YadA-like  37.25 
 
 		 597 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2583  YadA domain-containing protein  40.53 
 
 		 990 aa  90.1  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.138692  hitchhiker  0.000000000000200862 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  43.29 
 
 		 606 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2396  YadA domain protein  34.67 
 
 		 655 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  51.91 
 
 		 348 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  42.71 
 
 		 542 aa  88.6  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2893  YadA domain-containing protein  36.27 
 
 		 597 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45367  normal  0.508754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>