138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0878 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0878  triple helix repeat-containing collagen  100 
 
 		 303 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0304216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0838  Collagen triple helix repeat protein  96.04 
 
 		 297 aa  530  1e-149  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932228  normal  0.0295691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0804  Collagen triple helix repeat  69.09 
 
 		 288 aa  363  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.479308  normal  0.0397602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  51.55 
 
 		 283 aa  248  8e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  46.92 
 
 		 344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2011  triple helix repeat-containing collagen  50.18 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.160641 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  47.16 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  50.44 
 
 		 2851 aa  98.6  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1592  Collagen triple helix repeat protein  45 
 
 		 320 aa  89  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  54.46 
 
 		 582 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  55.56 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5433  triple helix repeat-containing collagen  40.34 
 
 		 232 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  47.41 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  48.8 
 
 		 2914 aa  82  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  44.81 
 
 		 442 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0713  Collagen triple helix repeat protein  53.45 
 
 		 322 aa  79.3  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  53.06 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  53.54 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  53.54 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4476  collagen-like protein  44.55 
 
 		 815 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.957246  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  46.23 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  53.06 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  53.06 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  34.98 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  48.31 
 
 		 493 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  50.47 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  43.45 
 
 		 842 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  45.83 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  47.79 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  52.48 
 
 		 645 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  48.6 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.06 
 
 		 689 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  51.02 
 
 		 434 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  37.8 
 
 		 706 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0538  triple helix repeat-containing collagen  38.95 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  47.66 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  35.33 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  35.5 
 
 		 1426 aa  70.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  46.53 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  47.66 
 
 		 585 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  48.62 
 
 		 643 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  42.62 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  46.73 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  48.51 
 
 		 712 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  39.2 
 
 		 1055 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  49.55 
 
 		 587 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  49.56 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  43.26 
 
 		 606 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  44.64 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  44.64 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  42.2 
 
 		 1219 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  39.82 
 
 		 469 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  43.14 
 
 		 274 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  46.23 
 
 		 813 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  37.5 
 
 		 767 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  45.05 
 
 		 582 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  39.02 
 
 		 459 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4623  triple helix repeat-containing collagen  39.82 
 
 		 647 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  38.26 
 
 		 426 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  40.28 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  40.91 
 
 		 524 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  43.93 
 
 		 639 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  44.55 
 
 		 748 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3386  hypothetical protein  42.4 
 
 		 867 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.12938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3360  hypothetical protein  45.54 
 
 		 835 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.888871  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  42.72 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  33.17 
 
 		 839 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  50 
 
 		 835 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  50.94 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  46.88 
 
 		 474 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4557  triple helix repeat-containing collagen  38.46 
 
 		 934 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  36.02 
 
 		 1168 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0398  collagen triple helix repeat domain protein  38.22 
 
 		 951 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.178342  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4868  triple helix repeat-containing collagen  38.31 
 
 		 1321 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  43.97 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2925  collagen triple helix repeat protein  47 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00742867 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  43.97 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  46.46 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  44.74 
 
 		 835 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  41.96 
 
 		 936 aa  62.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  41 
 
 		 380 aa  62.4  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  37.63 
 
 		 717 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  44.54 
 
 		 648 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  44.95 
 
 		 1147 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4578  Collagen triple helix repeat protein  50.5 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  41.18 
 
 		 838 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  42.61 
 
 		 1451 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  42.15 
 
 		 644 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  49.4 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  49.52 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4862  collagen triple helix repeat domain protein  37.74 
 
 		 1170 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4838  collagen triple helix repeat domain protein  39.87 
 
 		 1297 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0444265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3361  hypothetical protein  43.52 
 
 		 835 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  38.52 
 
 		 1101 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  37.17 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  37.5 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2465  BclA protein  42.2 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  44.19 
 
 		 445 aa  55.8  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  31.62 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2742  triple helix repeat-containing collagen  35.66 
 
 		 174 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>