103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1720 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1720  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 
558 aa  1085    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  0.0315117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  37.01 
 
 
1426 aa  98.6  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  39.83 
 
 
644 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  35.97 
 
 
699 aa  91.3  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  43.65 
 
 
730 aa  88.2  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1402  Collagen triple helix repeat protein  43.24 
 
 
190 aa  85.9  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  52.38 
 
 
2851 aa  80.9  0.00000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  45.9 
 
 
663 aa  75.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  39.25 
 
 
523 aa  62.4  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  56.72 
 
 
582 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  54.55 
 
 
2914 aa  57.8  0.0000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  57.58 
 
 
813 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  57.53 
 
 
712 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1804  tail fiber protein  54.84 
 
 
434 aa  54.7  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.982324  hitchhiker  0.00650595 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  58.57 
 
 
643 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  50 
 
 
380 aa  55.1  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  30.6 
 
 
616 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  47.83 
 
 
606 aa  54.7  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1007  Collagen triple helix repeat protein  49.28 
 
 
445 aa  54.7  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  34.62 
 
 
1421 aa  54.3  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2758  tail fiber protein  50 
 
 
439 aa  53.9  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.204827  normal  0.264951 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  52.11 
 
 
347 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  52.11 
 
 
347 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3118  tail fiber protein  50 
 
 
437 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.145222 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3557  hypothetical protein  53.62 
 
 
481 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285889  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3841  hypothetical protein  53.62 
 
 
478 aa  53.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000174288  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1924  triple helix repeat-containing collagen  51.47 
 
 
466 aa  53.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1203  tail fiber protein  48.68 
 
 
451 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2871  tail fiber protein  48.68 
 
 
437 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0235495 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3508  tail fiber protein  50 
 
 
645 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  53.62 
 
 
426 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  57.14 
 
 
585 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  50.75 
 
 
587 aa  52.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1479  triple helix repeat-containing collagen  38.64 
 
 
717 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  52.94 
 
 
542 aa  52.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  48.61 
 
 
344 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0915  tail fiber protein  53.85 
 
 
438 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2165  tail fiber protein  48.68 
 
 
437 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.468721  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2225  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  48.33 
 
 
490 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1338  group-specific protein  59.57 
 
 
436 aa  52  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00783091  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  33.12 
 
 
400 aa  52  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  36.94 
 
 
1231 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  44.44 
 
 
689 aa  51.6  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3684  triple helix repeat-containing collagen  50 
 
 
468 aa  51.2  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1426  triple helix repeat-containing collagen  41.51 
 
 
473 aa  50.8  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.937607  normal  0.524919 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  53.33 
 
 
295 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  45.83 
 
 
586 aa  50.4  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1925  triple helix repeat-containing collagen  45.57 
 
 
492 aa  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1549  group-specific protein  56.52 
 
 
512 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000333718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1067  Collagen triple helix repeat protein  39.88 
 
 
1089 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239328  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3469  triple helix repeat-containing collagen  54.29 
 
 
748 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  47.56 
 
 
582 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  47.76 
 
 
403 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  51.43 
 
 
936 aa  49.3  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  53.73 
 
 
459 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3721  collagen triple helix repeat protein  55.07 
 
 
706 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.98705e-33 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3739  hypothetical protein  58.21 
 
 
1147 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0102662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  51.52 
 
 
462 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4079  BclA protein  55.36 
 
 
314 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1075  Alkaline phosphatase  40.95 
 
 
635 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1245  Collagen triple helix repeat protein  55.56 
 
 
309 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.160346  normal  0.403174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2389  triple helix repeat-containing collagen  54.69 
 
 
842 aa  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00549275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0600  collagen triple helix repeat domain protein  50 
 
 
300 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.952581  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2467  exosporium protein H  52.46 
 
 
437 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  52.38 
 
 
253 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3227  triple helix repeat-containing collagen  50.82 
 
 
274 aa  47.8  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1304  Collagen triple helix repeat protein  47.95 
 
 
319 aa  47.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4263  triple helix repeat-containing collagen  43.59 
 
 
390 aa  47.4  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2697  hypothetical protein  50 
 
 
382 aa  47  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1681  hypothetical protein  56.45 
 
 
953 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  54.17 
 
 
1101 aa  47  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3456  triple helix repeat-containing collagen  51.32 
 
 
1168 aa  47  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00439724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2201  exosporium protein H  57.63 
 
 
428 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  50 
 
 
212 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1865  collagen triple helix repeat domain protein  43.53 
 
 
838 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.224261  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4844  collagen triple helix repeat domain protein  48.53 
 
 
1219 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  50.82 
 
 
580 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1104  bclA protein  50.75 
 
 
283 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  32 
 
 
756 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0939  Collagen triple helix repeat protein  60 
 
 
194 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0376709  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  50 
 
 
772 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2244  exosporium protein H  54.24 
 
 
435 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800271  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  45.45 
 
 
240 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0025  triple helix repeat-containing collagen  40 
 
 
366 aa  45.4  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.123658  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  44.78 
 
 
299 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  45.31 
 
 
839 aa  45.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1380  triple helix repeat-containing collagen  46.05 
 
 
474 aa  44.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0453849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3811  collagen triple helix repeat protein  53.12 
 
 
1451 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00707911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1866  hypothetical protein  49.32 
 
 
835 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5445  LmbE family protein  34.27 
 
 
1071 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4978  triple helix repeat-containing collagen  45.59 
 
 
469 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  47.27 
 
 
1029 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2599  triple helix repeat-containing collagen  53.12 
 
 
222 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0118729  normal  0.173421 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  40 
 
 
1408 aa  44.3  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
726 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  33.94 
 
 
1428 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4914  Collagen triple helix repeat protein  48.44 
 
 
283 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.209024  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4458  collagen-like protein  49.23 
 
 
1055 aa  43.9  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3387  hypothetical protein  43.04 
 
 
835 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.265829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4912  collagen triple helix repeat protein  41.77 
 
 
524 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>