42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1924 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 1029 aa  1959    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  38.13 
 
 		 772 aa  124  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  27.65 
 
 		 1736 aa  103  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  34.24 
 
 		 1073 aa  98.6  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1802 aa  91.3  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  26.27 
 
 		 1626 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  30.14 
 
 		 607 aa  75.9  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.29 
 
 		 1212 aa  66.6  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  25.15 
 
 		 756 aa  66.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1193 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  32.93 
 
 		 586 aa  63.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4963  hypothetical protein  28.97 
 
 		 897 aa  63.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.771854 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  25.73 
 
 		 2239 aa  61.6  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  33.65 
 
 		 616 aa  59.7  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  29.85 
 
 		 974 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  34.97 
 
 		 1426 aa  57  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  36.09 
 
 		 1428 aa  56.6  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  30.57 
 
 		 1303 aa  52.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  27.71 
 
 		 1838 aa  52  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1720  Collagen triple helix repeat protein  33.68 
 
 		 558 aa  51.6  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  0.0315117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  43.37 
 
 		 685 aa  51.2  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  32.72 
 
 		 1424 aa  51.2  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.1 
 
 		 726 aa  51.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1067  Collagen triple helix repeat protein  28.91 
 
 		 1089 aa  50.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239328  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6412  Pyrrolo-quinoline quinone  27.66 
 
 		 1192 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.152468 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  42.35 
 
 		 720 aa  50.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  37.97 
 
 		 663 aa  48.9  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.26 
 
 		 1001 aa  48.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1289 aa  48.1  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3370  Kelch repeat-containing protein  37.5 
 
 		 642 aa  48.1  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.198533 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  38.46 
 
 		 4379 aa  47.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  37.38 
 
 		 657 aa  47.4  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0341  hypothetical protein  30.34 
 
 		 427 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.156991  hitchhiker  0.00506023 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  27.03 
 
 		 1313 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  39 
 
 		 662 aa  46.2  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  34.86 
 
 		 644 aa  45.8  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3399  hypothetical protein  28.15 
 
 		 229 aa  45.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852538  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  27.04 
 
 		 510 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  33.33 
 
 		 1035 aa  45.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  32.95 
 
 		 2117 aa  45.1  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2713  hypothetical protein  26.89 
 
 		 229 aa  44.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0941  hypothetical protein  35.87 
 
 		 791 aa  44.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.10709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>