199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3449 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  100 
 
 		 663 aa  1214    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.71 
 
 		 2194 aa  149  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  31.69 
 
 		 644 aa  148  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  33.53 
 
 		 1019 aa  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.62 
 
 		 1118 aa  142  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  34.06 
 
 		 1838 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  30.78 
 
 		 616 aa  134  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.66 
 
 		 1340 aa  133  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.76 
 
 		 1113 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.96 
 
 		 1222 aa  131  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.74 
 
 		 1225 aa  130  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.65 
 
 		 889 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  38.05 
 
 		 1426 aa  118  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.06 
 
 		 1009 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  34.05 
 
 		 974 aa  113  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  32.89 
 
 		 1275 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  30.17 
 
 		 2807 aa  108  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  29.74 
 
 		 1557 aa  107  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  34.02 
 
 		 657 aa  107  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  30.57 
 
 		 872 aa  103  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  29.39 
 
 		 1289 aa  103  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.01 
 
 		 891 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  34.04 
 
 		 1126 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  35.56 
 
 		 386 aa  101  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  33.11 
 
 		 1490 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.19 
 
 		 1012 aa  100  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  34.84 
 
 		 828 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  32.59 
 
 		 412 aa  97.8  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  35.65 
 
 		 662 aa  97.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1720  Collagen triple helix repeat protein  42.42 
 
 		 558 aa  91.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  0.0315117 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  26.51 
 
 		 813 aa  90.5  9e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  33.8 
 
 		 604 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  24.54 
 
 		 4379 aa  88.6  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  30.41 
 
 		 1124 aa  83.2  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  32.07 
 
 		 554 aa  80.5  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0478  cell-surface large adhesin  44.21 
 
 		 2851 aa  79.3  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  32.48 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  41.9 
 
 		 2914 aa  74.7  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  29 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  29.12 
 
 		 456 aa  72  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  31.02 
 
 		 720 aa  71.2  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  30.28 
 
 		 3197 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  28.26 
 
 		 3197 aa  67  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.86 
 
 		 726 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  33.11 
 
 		 1421 aa  65.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  26.7 
 
 		 438 aa  64.7  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5064  Collagen triple helix repeat protein  52.11 
 
 		 839 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1262  BclA protein  51.32 
 
 		 295 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3152  BclA protein  34.38 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0005  BclA protein  34.38 
 
 		 347 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  24.52 
 
 		 523 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  27.91 
 
 		 485 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  25.61 
 
 		 494 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.24 
 
 		 1212 aa  62  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  44.55 
 
 		 582 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  26.41 
 
 		 569 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.91 
 
 		 689 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  39.78 
 
 		 607 aa  60.5  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4655  collagen triple helix repeat domain protein  47.67 
 
 		 426 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0586  Collagen triple helix repeat protein  48.75 
 
 		 606 aa  59.7  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  54.24 
 
 		 772 aa  59.3  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3470  triple helix repeat-containing collagen  43.75 
 
 		 813 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.943395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  32.71 
 
 		 1736 aa  58.9  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  39.29 
 
 		 1408 aa  58.5  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3686  triple helix repeat-containing collagen  34.15 
 
 		 587 aa  57.8  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4654  hypothetical protein  50.65 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1926  triple helix repeat-containing collagen  45.35 
 
 		 582 aa  57  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  47.44 
 
 		 400 aa  57  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1339  collagen-like protein  51.95 
 
 		 712 aa  56.2  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1618  group-specific protein  48.19 
 
 		 643 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1728  hypothetical protein  35.32 
 
 		 699 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.463962  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1008  Collagen triple helix repeat protein  43.75 
 
 		 380 aa  56.2  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1193 aa  55.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1067  Collagen triple helix repeat protein  35.85 
 
 		 1089 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.239328  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4639  collagen triple helix repeat domain protein  50 
 
 		 360 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  22.88 
 
 		 917 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13970  collagen triple helix repeat protein  36.11 
 
 		 523 aa  55.5  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2280  triple helix repeat-containing collagen  41.25 
 
 		 299 aa  55.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0151545  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  23.21 
 
 		 517 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3477  triple helix repeat-containing collagen  47.56 
 
 		 936 aa  55.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00171179  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  35.19 
 
 		 1303 aa  55.1  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1581  hypothetical protein  50.6 
 
 		 585 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.322632  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1402  Collagen triple helix repeat protein  37.42 
 
 		 190 aa  54.7  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4635  collagen triple helix repeat domain protein  47.37 
 
 		 459 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.179421  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  38.46 
 
 		 161 aa  54.7  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0148  collagen triple helix repeat protein  45.95 
 
 		 639 aa  54.7  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  24.22 
 
 		 524 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4328  Collagen triple helix repeat protein  38.41 
 
 		 730 aa  54.7  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.672147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  30.86 
 
 		 586 aa  54.7  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0593  hypothetical protein  28.3 
 
 		 435 aa  54.3  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.26 
 
 		 1208 aa  54.7  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2240  hypothetical protein  28.27 
 
 		 258 aa  54.3  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3402  triple helix repeat-containing collagen  48.72 
 
 		 253 aa  54.3  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000301368 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2198  hypothetical protein  39.51 
 
 		 240 aa  53.9  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  24.64 
 
 		 510 aa  53.9  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 2082 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.8 
 
 		 1001 aa  53.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  42.64 
 
 		 1580 aa  53.9  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0682  triple helix repeat-containing collagen  39.58 
 
 		 542 aa  53.9  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3685  triple helix repeat-containing collagen  45 
 
 		 493 aa  52.8  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>