108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1394 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  100 
 
 		 1303 aa  2637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  46.17 
 
 		 1201 aa  739    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  49.81 
 
 		 1380 aa  929    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  46.78 
 
 		 1430 aa  898    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  38.84 
 
 		 1247 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  63.68 
 
 		 1601 aa  1581    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  46.84 
 
 		 1363 aa  929    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  45.4 
 
 		 1299 aa  847    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  48.17 
 
 		 1736 aa  1097    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  46.58 
 
 		 1272 aa  892    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  49.72 
 
 		 1363 aa  926    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  46.28 
 
 		 1299 aa  853    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  37.66 
 
 		 1248 aa  618  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  52.7 
 
 		 1308 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  38.95 
 
 		 1973 aa  439  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  32.21 
 
 		 734 aa  242  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  27.46 
 
 		 647 aa  111  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  29.97 
 
 		 625 aa  90.9  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  26.01 
 
 		 1094 aa  90.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  35.6 
 
 		 620 aa  87.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  34.2 
 
 		 647 aa  85.5  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  28.57 
 
 		 523 aa  81.6  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  31.58 
 
 		 661 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  32.34 
 
 		 798 aa  81.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  41.23 
 
 		 608 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  30.5 
 
 		 799 aa  79.7  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  33.01 
 
 		 631 aa  79.7  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  27.14 
 
 		 779 aa  78.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  28.57 
 
 		 698 aa  77.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  30.19 
 
 		 798 aa  76.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  27.5 
 
 		 779 aa  75.9  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  33.33 
 
 		 708 aa  75.5  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  30.71 
 
 		 677 aa  74.3  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  29.37 
 
 		 687 aa  73.2  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  27.27 
 
 		 625 aa  72.8  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5033  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.46 
 
 		 1001 aa  72.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34.55 
 
 		 1035 aa  71.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  44.9 
 
 		 3507 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  24.82 
 
 		 872 aa  70.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  34.62 
 
 		 1042 aa  70.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  30.6 
 
 		 676 aa  69.3  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  31.64 
 
 		 826 aa  66.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  26.99 
 
 		 840 aa  66.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  30.48 
 
 		 536 aa  66.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  33.12 
 
 		 643 aa  65.9  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  36.36 
 
 		 2117 aa  63.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2160  hypothetical protein  37.29 
 
 		 607 aa  64.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.750892  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  34.11 
 
 		 1428 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  39.81 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  27.05 
 
 		 706 aa  62.4  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  32.65 
 
 		 340 aa  61.2  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  36.04 
 
 		 586 aa  61.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 		 726 aa  59.7  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.59 
 
 		 1212 aa  59.3  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1066  hypothetical protein  37.07 
 
 		 1193 aa  58.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0974046 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  38.89 
 
 		 772 aa  58.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  37.17 
 
 		 1109 aa  58.2  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  40 
 
 		 2690 aa  58.2  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  34.29 
 
 		 1424 aa  57  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  38.18 
 
 		 1310 aa  56.6  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  38.24 
 
 		 480 aa  56.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3641  hypothetical protein  37.39 
 
 		 332 aa  56.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.04 
 
 		 1073 aa  54.3  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  35.19 
 
 		 663 aa  54.3  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  36.52 
 
 		 2082 aa  53.5  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  27.68 
 
 		 835 aa  53.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0343  hypothetical protein  39.64 
 
 		 1802 aa  52.4  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.691393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  40 
 
 		 4433 aa  52.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  27.74 
 
 		 508 aa  52.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  40.91 
 
 		 864 aa  52.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  30.57 
 
 		 1029 aa  52  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  33.33 
 
 		 2002 aa  52  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  28.85 
 
 		 486 aa  51.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  30.56 
 
 		 995 aa  51.2  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  27.66 
 
 		 616 aa  50.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4088  hypothetical protein  37.61 
 
 		 756 aa  50.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0768216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2670  glycosy hydrolase family protein  30.4 
 
 		 812 aa  49.7  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4284  hypothetical protein  34.71 
 
 		 2169 aa  49.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  29.44 
 
 		 644 aa  49.3  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  33.58 
 
 		 1626 aa  49.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  29.93 
 
 		 528 aa  48.9  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  30.77 
 
 		 515 aa  48.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  31.9 
 
 		 506 aa  48.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  37.33 
 
 		 331 aa  48.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  32.04 
 
 		 536 aa  48.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2697  legume lectin beta domain protein  36.13 
 
 		 1236 aa  48.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0132334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  26.88 
 
 		 569 aa  48.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6866  Bilirubin oxidase  25.71 
 
 		 496 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  25.32 
 
 		 679 aa  47.8  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1924  Bilirubin oxidase  28.57 
 
 		 528 aa  47.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01460  cell wall associated biofilm protein  32.32 
 
 		 2239 aa  47.8  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  45.24 
 
 		 792 aa  47.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  33.9 
 
 		 527 aa  47.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  29.01 
 
 		 1735 aa  47.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  29.31 
 
 		 505 aa  47  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  32.2 
 
 		 1113 aa  46.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  36 
 
 		 861 aa  46.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  31.86 
 
 		 512 aa  46.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  42.86 
 
 		 1004 aa  45.8  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  37.11 
 
 		 2334 aa  45.8  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>