78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2415 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 720 aa  1343    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  30.91 
 
 		 616 aa  122  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  32.85 
 
 		 657 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.87 
 
 		 1009 aa  94.4  7e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  33.6 
 
 		 1490 aa  94  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  29.14 
 
 		 1019 aa  90.5  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  28.53 
 
 		 1838 aa  88.2  5e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.89 
 
 		 2194 aa  85.1  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  28.64 
 
 		 2807 aa  81.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  28 
 
 		 1289 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  28.85 
 
 		 828 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  29.13 
 
 		 644 aa  77.4  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  31.46 
 
 		 974 aa  77.4  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.27 
 
 		 891 aa  73.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.11 
 
 		 1222 aa  73.9  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  28.1 
 
 		 1126 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  30 
 
 		 1275 aa  72  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  29.29 
 
 		 438 aa  72  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  27.31 
 
 		 662 aa  71.2  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  35.6 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  30.22 
 
 		 663 aa  68.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  25.21 
 
 		 4379 aa  67.8  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.93 
 
 		 1113 aa  67.8  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  27.97 
 
 		 554 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  26.97 
 
 		 685 aa  65.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  26.93 
 
 		 872 aa  63.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.46 
 
 		 889 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  34.11 
 
 		 386 aa  62  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.1 
 
 		 1340 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.16 
 
 		 1012 aa  62  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1638 aa  60.8  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  28.29 
 
 		 813 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.1 
 
 		 1114 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.21 
 
 		 1225 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.33 
 
 		 1118 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  27.99 
 
 		 437 aa  59.7  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  28.87 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  23.74 
 
 		 1557 aa  58.9  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  27.6 
 
 		 3197 aa  58.5  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  30.27 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1878  hypothetical protein  43.01 
 
 		 635 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154844  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  25.17 
 
 		 1527 aa  54.3  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  27.8 
 
 		 604 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3360  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  38.32 
 
 		 772 aa  53.9  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0508989 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  28.71 
 
 		 447 aa  51.6  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1470  Kelch repeat-containing protein  41.54 
 
 		 586 aa  51.6  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00615821  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  26.11 
 
 		 1109 aa  51.6  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  28.43 
 
 		 1437 aa  51.2  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.16 
 
 		 11716 aa  50.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  26.1 
 
 		 485 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  24.36 
 
 		 404 aa  50.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  26.91 
 
 		 3197 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1924  FG-GAP repeat protein  42.35 
 
 		 1029 aa  50.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  32 
 
 		 500 aa  50.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6179  peptidase M12A astacin  28.57 
 
 		 615 aa  49.3  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0299292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  27.37 
 
 		 402 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  27.46 
 
 		 1337 aa  47.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  25.5 
 
 		 524 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  29.91 
 
 		 469 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  27.54 
 
 		 1022 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0012  integrin-like repeat-containing protein  25.24 
 
 		 565 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257714  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  33.93 
 
 		 161 aa  46.2  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0492  peptidase M36 fungalysin  39.81 
 
 		 1147 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.921805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.68 
 
 		 621 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.79 
 
 		 453 aa  46.2  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  27.42 
 
 		 456 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  32.84 
 
 		 406 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  29.5 
 
 		 752 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 		 1184 aa  45.8  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  26.79 
 
 		 803 aa  45.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  31.34 
 
 		 1124 aa  45.8  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  41.18 
 
 		 681 aa  45.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  28.57 
 
 		 510 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.86 
 
 		 1228 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  42.11 
 
 		 1073 aa  45.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.17 
 
 		 1208 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  32.28 
 
 		 1421 aa  44.3  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1414  hypothetical protein  23.91 
 
 		 2534 aa  44.3  0.009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.733329 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>