103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4093 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  100 
 
 		 494 aa  999    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  37.33 
 
 		 485 aa  272  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  38.94 
 
 		 472 aa  271  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  39.62 
 
 		 469 aa  266  8.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30 
 
 		 891 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  31.05 
 
 		 1019 aa  114  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  31.23 
 
 		 604 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.81 
 
 		 1340 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.43 
 
 		 1118 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.16 
 
 		 889 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.18 
 
 		 2194 aa  100  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  31.39 
 
 		 1126 aa  99.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  32.72 
 
 		 1490 aa  97.8  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.52 
 
 		 1222 aa  97.1  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  34.06 
 
 		 974 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  32.88 
 
 		 1838 aa  93.2  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  32.31 
 
 		 872 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  32.92 
 
 		 1275 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.28 
 
 		 1113 aa  91.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.18 
 
 		 2807 aa  91.3  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.22 
 
 		 1009 aa  86.7  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.73 
 
 		 1225 aa  84.3  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  27.98 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  28.65 
 
 		 813 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  28.32 
 
 		 1124 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4122  hypothetical protein  25.78 
 
 		 508 aa  75.1  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  30.94 
 
 		 4379 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  30.83 
 
 		 828 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  29.41 
 
 		 685 aa  73.9  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  28.77 
 
 		 657 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  29.92 
 
 		 616 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  25.25 
 
 		 554 aa  70.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  24.81 
 
 		 917 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  25.26 
 
 		 663 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  27.51 
 
 		 1289 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  27.57 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.85 
 
 		 1012 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  30.96 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.29 
 
 		 3197 aa  64.3  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  28.14 
 
 		 1557 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  27.87 
 
 		 644 aa  61.6  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  27.33 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.07 
 
 		 959 aa  58.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 1127 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.63 
 
 		 635 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  29.72 
 
 		 3197 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.89 
 
 		 621 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  26.76 
 
 		 11716 aa  55.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  26.51 
 
 		 1348 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  28.11 
 
 		 517 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4776  hypothetical protein  26.54 
 
 		 841 aa  53.5  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174765  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  23.46 
 
 		 438 aa  53.9  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  26.82 
 
 		 1346 aa  53.5  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1638 aa  52.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  24.39 
 
 		 1114 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  29.89 
 
 		 803 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  29.56 
 
 		 593 aa  50.1  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  28.5 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3235  hypothetical protein  26.6 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.19 
 
 		 1236 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.85 
 
 		 1189 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1655  FG-GAP repeat-containing protein  24.68 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418657  normal  0.573557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  29.15 
 
 		 1109 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  28.47 
 
 		 1437 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3161  FG-GAP repeat protein  28.39 
 
 		 753 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000585686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0507  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.93 
 
 		 2032 aa  47.4  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584165  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2935  FG-GAP repeat protein  30.46 
 
 		 749 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  26.58 
 
 		 524 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  26.94 
 
 		 523 aa  47  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5746  YD repeat protein  27.85 
 
 		 2652 aa  46.6  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  29.13 
 
 		 569 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5091  FG-GAP repeat protein  29.17 
 
 		 662 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.246094 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.09 
 
 		 1154 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.08 
 
 		 1193 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.04 
 
 		 1226 aa  45.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.08 
 
 		 737 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4097  phosphoesterase  36.62 
 
 		 396 aa  45.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.217924 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  26.64 
 
 		 510 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  29.21 
 
 		 749 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  31.73 
 
 		 566 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3884  YD repeat protein  26.96 
 
 		 1879 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  26.17 
 
 		 1166 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2855  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1825 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2231  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1825 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.685998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0008  FG-GAP/YD repeat-containing protein  24.52 
 
 		 1806 aa  43.9  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.957829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  26.42 
 
 		 649 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  25.38 
 
 		 499 aa  43.9  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  27.15 
 
 		 645 aa  43.9  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.01 
 
 		 1170 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  25 
 
 		 590 aa  43.9  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0606  Rhs family protein  25.93 
 
 		 2031 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30 
 
 		 1066 aa  43.9  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  26.56 
 
 		 1022 aa  43.9  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  24.32 
 
 		 794 aa  43.9  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0792  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.93 
 
 		 2031 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.766885  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0622  FG-GAP/YD repeat-containing protein  25.93 
 
 		 2031 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3715  FG-GAP repeat-containing protein  31.12 
 
 		 514 aa  43.5  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  27.05 
 
 		 1337 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  38.36 
 
 		 1098 aa  43.5  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  38.36 
 
 		 1208 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>