50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4195 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  64.24 
 
 		 752 aa  984    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 749 aa  1523    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  38.34 
 
 		 1348 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  37.4 
 
 		 1337 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  36.32 
 
 		 1346 aa  376  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  35.7 
 
 		 1437 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  35.81 
 
 		 1433 aa  348  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.71 
 
 		 11716 aa  132  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.52 
 
 		 2507 aa  120  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  30.3 
 
 		 640 aa  111  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  28.57 
 
 		 702 aa  108  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  27.41 
 
 		 1434 aa  108  4e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  29.46 
 
 		 621 aa  106  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  29.39 
 
 		 1827 aa  105  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.22 
 
 		 1073 aa  90.9  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  26.39 
 
 		 2064 aa  90.9  8e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  26.56 
 
 		 706 aa  89.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  30.36 
 
 		 937 aa  87.4  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  26.81 
 
 		 811 aa  85.5  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  28.18 
 
 		 885 aa  70.9  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  24.71 
 
 		 500 aa  70.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  27.25 
 
 		 974 aa  66.2  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  28.74 
 
 		 466 aa  66.6  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  29.57 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  27.91 
 
 		 819 aa  65.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  24.73 
 
 		 935 aa  58.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3228  hypothetical protein  30.73 
 
 		 485 aa  57.4  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  26.5 
 
 		 503 aa  55.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1909  FG-GAP repeat-containing protein  34.26 
 
 		 458 aa  53.9  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  31.76 
 
 		 788 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.12 
 
 		 635 aa  50.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2248  hypothetical protein  31.76 
 
 		 549 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2581  hypothetical protein  27.1 
 
 		 484 aa  48.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000219453  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  31.13 
 
 		 1059 aa  48.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  25.49 
 
 		 1557 aa  48.1  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  23.48 
 
 		 655 aa  47.8  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  31.73 
 
 		 748 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.89 
 
 		 959 aa  47.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.78 
 
 		 1118 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.73 
 
 		 1012 aa  47.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.39 
 
 		 1490 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  27.63 
 
 		 742 aa  46.6  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  34.57 
 
 		 617 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  33.68 
 
 		 717 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  29.21 
 
 		 494 aa  45.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  27.06 
 
 		 1295 aa  45.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04140  metalloprotease, putative  31.17 
 
 		 887 aa  45.1  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.700995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  23.22 
 
 		 524 aa  44.7  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  29.86 
 
 		 1166 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0444  hypothetical protein  35.06 
 
 		 1394 aa  44.3  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>