31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1222 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 885 aa  1681    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  37.55 
 
 		 1434 aa  172  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.88 
 
 		 11716 aa  140  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  34.7 
 
 		 640 aa  137  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  36.3 
 
 		 702 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  36.41 
 
 		 1827 aa  134  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  31.68 
 
 		 1437 aa  124  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.54 
 
 		 2507 aa  123  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  32.57 
 
 		 621 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  35.46 
 
 		 937 aa  110  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  33.26 
 
 		 503 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  30.21 
 
 		 1337 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  30.13 
 
 		 1433 aa  104  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  30.68 
 
 		 1346 aa  102  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  33.43 
 
 		 935 aa  100  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  27.35 
 
 		 1348 aa  94.7  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  28.32 
 
 		 819 aa  87.8  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  34.46 
 
 		 1073 aa  83.2  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5626  Htaa domain protein  51.47 
 
 		 800 aa  82.4  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.259672 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  24.4 
 
 		 2064 aa  81.3  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  30.23 
 
 		 706 aa  79.7  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  27.51 
 
 		 752 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2877  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.18 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.651408  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  28.18 
 
 		 749 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  27.74 
 
 		 811 aa  73.2  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  30.89 
 
 		 500 aa  66.6  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2366  Htaa domain protein  29.97 
 
 		 1127 aa  65.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527032  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2988  Htaa domain protein  43.01 
 
 		 994 aa  53.9  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.360944  normal  0.268871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3228  hypothetical protein  30.9 
 
 		 485 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  27.69 
 
 		 466 aa  46.2  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0581  Htaa domain protein  31.13 
 
 		 1098 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.892764  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>