37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2093 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  100 
 
 		 702 aa  1308    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  60.91 
 
 		 621 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  65.21 
 
 		 1434 aa  553  1e-156  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  55.45 
 
 		 11716 aa  468  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  57.35 
 
 		 640 aa  458  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  54.15 
 
 		 706 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  47.95 
 
 		 1827 aa  265  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  34.35 
 
 		 2064 aa  244  3e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  34.83 
 
 		 811 aa  233  7.000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.59 
 
 		 2507 aa  226  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  34.22 
 
 		 819 aa  225  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  32.66 
 
 		 1437 aa  198  3e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  39.47 
 
 		 937 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  33.27 
 
 		 503 aa  173  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  32.75 
 
 		 1346 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  33.52 
 
 		 1433 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  32.33 
 
 		 1348 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  32.19 
 
 		 1337 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  34.11 
 
 		 1073 aa  149  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  34.94 
 
 		 935 aa  119  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  32.39 
 
 		 752 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  35.61 
 
 		 885 aa  119  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  28.45 
 
 		 749 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  28.24 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  28.42 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1909  FG-GAP repeat-containing protein  31.33 
 
 		 458 aa  50.8  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.93 
 
 		 959 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  25.06 
 
 		 466 aa  48.9  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  27.88 
 
 		 3204 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  27.88 
 
 		 2911 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  36.13 
 
 		 458 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3228  hypothetical protein  28.65 
 
 		 485 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  26.67 
 
 		 3193 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.56 
 
 		 1154 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  24.8 
 
 		 539 aa  44.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  21.49 
 
 		 861 aa  43.9  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  26.49 
 
 		 1129 aa  43.9  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>