129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2527 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  44.95 
 
 		 1437 aa  1056    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 1433 aa  2882    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  44.43 
 
 		 1346 aa  978    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  48.91 
 
 		 1337 aa  1062    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  46.2 
 
 		 1348 aa  1007    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  37.02 
 
 		 752 aa  368  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  35.67 
 
 		 749 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  33.52 
 
 		 702 aa  166  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  35.27 
 
 		 1434 aa  157  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  34.82 
 
 		 937 aa  150  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  41.71 
 
 		 755 aa  143  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  31.88 
 
 		 621 aa  141  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.02 
 
 		 11716 aa  139  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  33.42 
 
 		 1827 aa  138  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  32.97 
 
 		 640 aa  136  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  38.55 
 
 		 1668 aa  135  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.34 
 
 		 1773 aa  132  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  43.09 
 
 		 1147 aa  132  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  40.45 
 
 		 501 aa  132  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  40 
 
 		 324 aa  128  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  36.52 
 
 		 341 aa  127  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.38 
 
 		 2507 aa  126  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  40.34 
 
 		 646 aa  124  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  40.78 
 
 		 1296 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  35.29 
 
 		 333 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  40.94 
 
 		 700 aa  119  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  37.78 
 
 		 1174 aa  119  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  35.96 
 
 		 495 aa  119  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  38.1 
 
 		 541 aa  118  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  36.84 
 
 		 757 aa  116  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  36.72 
 
 		 371 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.42 
 
 		 1073 aa  114  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  35.39 
 
 		 491 aa  112  5e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  39.62 
 
 		 394 aa  111  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  23.44 
 
 		 2064 aa  109  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  34 
 
 		 657 aa  109  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  37.64 
 
 		 1029 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  37.16 
 
 		 362 aa  108  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  37.65 
 
 		 1003 aa  108  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  32.4 
 
 		 340 aa  107  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  30.08 
 
 		 706 aa  106  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  36.07 
 
 		 571 aa  104  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  39.77 
 
 		 408 aa  104  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  37.64 
 
 		 336 aa  102  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.6 
 
 		 1015 aa  100  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  31.62 
 
 		 885 aa  99  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  29.57 
 
 		 503 aa  97.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  34.55 
 
 		 634 aa  96.3  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  35.2 
 
 		 366 aa  95.5  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  30.59 
 
 		 736 aa  95.1  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  27.62 
 
 		 811 aa  94.7  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2794  hypothetical protein  34.78 
 
 		 725 aa  94.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.423654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  34.68 
 
 		 996 aa  94  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  37.57 
 
 		 376 aa  93.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  32.02 
 
 		 1294 aa  93.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  36.78 
 
 		 1575 aa  92.4  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  33.52 
 
 		 933 aa  90.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1919  hypothetical protein  47.25 
 
 		 308 aa  89.7  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  32.37 
 
 		 665 aa  89  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  36.65 
 
 		 571 aa  89  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  35.93 
 
 		 558 aa  88.6  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  33.82 
 
 		 477 aa  87.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  32.76 
 
 		 543 aa  87.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  27.47 
 
 		 688 aa  87.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  35.94 
 
 		 601 aa  87  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  30.3 
 
 		 803 aa  87  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  28.7 
 
 		 500 aa  86.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.48 
 
 		 1783 aa  82.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  32.63 
 
 		 428 aa  81.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  30.06 
 
 		 221 aa  81.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  32.97 
 
 		 686 aa  80.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  29.41 
 
 		 846 aa  79  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  33.53 
 
 		 900 aa  79  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.41 
 
 		 570 aa  78.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1263 aa  78.6  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  27.78 
 
 		 819 aa  77.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  31.18 
 
 		 347 aa  76.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  31.49 
 
 		 367 aa  75.5  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  31.95 
 
 		 1318 aa  75.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  29.28 
 
 		 398 aa  72.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  31.71 
 
 		 1055 aa  72.4  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  29.74 
 
 		 701 aa  72  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1215 aa  72  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4401  lipolytic protein G-D-S-L family  26.06 
 
 		 728 aa  71.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  29.98 
 
 		 466 aa  70.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6627  hypothetical protein  26.82 
 
 		 523 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.665855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6753  hypothetical protein  30.11 
 
 		 876 aa  67.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.21551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  30 
 
 		 647 aa  67.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  67  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.37 
 
 		 635 aa  66.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.25 
 
 		 1797 aa  66.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  28.77 
 
 		 935 aa  65.9  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.05 
 
 		 621 aa  63.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  36.28 
 
 		 254 aa  59.3  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.47 
 
 		 959 aa  59.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  26.38 
 
 		 1126 aa  59.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  24.04 
 
 		 693 aa  57  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2067  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.15 
 
 		 687 aa  55.5  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6992  hypothetical protein  25.86 
 
 		 1087 aa  55.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160611  normal  0.0433397 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.19 
 
 		 682 aa  53.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>