46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4196 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  64.24 
 
 		 749 aa  963    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 752 aa  1515    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  39.23 
 
 		 1348 aa  409  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  38.5 
 
 		 1337 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  37.56 
 
 		 1346 aa  394  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  37.02 
 
 		 1433 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  36.46 
 
 		 1437 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.63 
 
 		 11716 aa  139  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  29.52 
 
 		 1434 aa  116  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.6 
 
 		 2507 aa  112  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  31.38 
 
 		 1827 aa  111  5e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  30.42 
 
 		 702 aa  111  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  27.84 
 
 		 621 aa  104  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  29.52 
 
 		 937 aa  96.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  36.43 
 
 		 640 aa  95.5  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  28.19 
 
 		 811 aa  91.7  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  27.68 
 
 		 2064 aa  84.7  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  27.18 
 
 		 706 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.78 
 
 		 1073 aa  73.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  29.24 
 
 		 885 aa  69.7  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  29.02 
 
 		 819 aa  68.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  27.27 
 
 		 974 aa  68.2  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  27.23 
 
 		 935 aa  62  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  27 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  31.98 
 
 		 503 aa  56.6  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.77 
 
 		 959 aa  55.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  27.79 
 
 		 466 aa  55.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05520  hypothetical protein  28.95 
 
 		 742 aa  50.8  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  27.95 
 
 		 1490 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  27.05 
 
 		 1126 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  25.57 
 
 		 447 aa  49.3  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  31.25 
 
 		 1059 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  22.73 
 
 		 402 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  23.29 
 
 		 406 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  31.58 
 
 		 788 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  30.62 
 
 		 404 aa  48.5  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.35 
 
 		 1208 aa  47  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2248  hypothetical protein  31.33 
 
 		 549 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2009  Cellulase  29.41 
 
 		 748 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.428719  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1909  FG-GAP repeat-containing protein  35.96 
 
 		 458 aa  46.6  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2185  beta and gamma crystallin  28.3 
 
 		 483 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421381  hitchhiker  0.000898498 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3228  hypothetical protein  30.25 
 
 		 485 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0137  Kelch repeat protein  23.24 
 
 		 1656 aa  45.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.175208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4197  peptidase domain protein  33.33 
 
 		 1063 aa  45.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000751128  normal  0.547659 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  27.88 
 
 		 691 aa  44.3  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01750  hypothetical protein  28.44 
 
 		 669 aa  43.9  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>