27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0490 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  100 
 
 		 691 aa  1405    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  37.3 
 
 		 1303 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  36.63 
 
 		 1386 aa  99.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  32.79 
 
 		 774 aa  88.6  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  33.87 
 
 		 2278 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  32.42 
 
 		 1748 aa  70.5  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1764  hypothetical protein  29.94 
 
 		 1079 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00516909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  43.82 
 
 		 1160 aa  67.8  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4548  hypothetical protein  42.86 
 
 		 659 aa  63.9  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546791  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  32.6 
 
 		 1750 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  34.62 
 
 		 1275 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2477  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1414 aa  59.3  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  34.31 
 
 		 1302 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  41.79 
 
 		 1108 aa  54.3  0.000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3498  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1440 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  34.65 
 
 		 1414 aa  52.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  39.8 
 
 		 1228 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3440  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1439 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  33.33 
 
 		 915 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.33 
 
 		 1679 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4180  conserved repeat domain protein  48.33 
 
 		 990 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.245505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2248  hypothetical protein  36 
 
 		 549 aa  48.5  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0804  hypothetical protein  34.67 
 
 		 946 aa  47.8  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.771937  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  24.81 
 
 		 461 aa  45.8  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  33.72 
 
 		 1187 aa  45.4  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  27.88 
 
 		 752 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03454  Nuclear pore complex protein An-Pom152 (Eurofung)  26.83 
 
 		 1257 aa  44.3  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.1051  normal  0.031908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>