14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4548 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4548  hypothetical protein  100 
 
 		 659 aa  1338    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546791  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1764  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1079 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00516909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3498  hypothetical protein  27.5 
 
 		 1440 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2477  hypothetical protein  29.18 
 
 		 1414 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  30.64 
 
 		 1386 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  30.1 
 
 		 2278 aa  113  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  30.07 
 
 		 1303 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3440  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1439 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  34.51 
 
 		 1750 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0042  metallophosphoesterase  30.05 
 
 		 774 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0825488 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  42.86 
 
 		 691 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1765  hypothetical protein  25.14 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000499471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  33.75 
 
 		 915 aa  50.8  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5454  conserved repeat domain protein  31.25 
 
 		 792 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.901976  normal  0.718716 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>