27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2850 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  100 
 
 
915 aa  1848    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  36.92 
 
 
1332 aa  176  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  42.22 
 
 
3682 aa  80.5  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1075  beta-glycosidase-like protein  29.34 
 
 
2690 aa  65.5  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.243053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  46.67 
 
 
3851 aa  64.3  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  41.94 
 
 
1331 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  35.6 
 
 
2416 aa  63.2  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0837  hypothetical protein  37.08 
 
 
1184 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  33.66 
 
 
1028 aa  61.6  0.00000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  44.74 
 
 
1223 aa  61.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  40.4 
 
 
1750 aa  57.8  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2050  hypothetical protein  39.73 
 
 
446 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.639352  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3077  hypothetical protein  27.15 
 
 
673 aa  57.4  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  29.44 
 
 
1452 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2477  hypothetical protein  35.24 
 
 
1414 aa  55.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.130692  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4180  conserved repeat domain protein  45.21 
 
 
990 aa  53.1  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.245505 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3498  hypothetical protein  36.25 
 
 
1440 aa  52  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.309515  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4548  hypothetical protein  33.75 
 
 
659 aa  51.6  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546791  normal  0.809273 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3021  hypothetical protein  33.78 
 
 
244 aa  49.7  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0804  hypothetical protein  34.45 
 
 
946 aa  50.1  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.771937  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  33.33 
 
 
691 aa  49.7  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  37.35 
 
 
1303 aa  47.8  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  43.33 
 
 
1068 aa  46.2  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0220  hypothetical protein  35.71 
 
 
948 aa  45.8  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000317657  normal  0.15907 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  25.07 
 
 
1918 aa  45.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  40.28 
 
 
1386 aa  45.4  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  45.61 
 
 
953 aa  45.1  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>