84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1906 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  69.36 
 
 		 3851 aa  4093    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  100 
 
 		 3682 aa  7145    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  31.19 
 
 		 1313 aa  341  1.9999999999999998e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  31.53 
 
 		 1245 aa  268  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0220  hypothetical protein  36.21 
 
 		 948 aa  207  4e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000317657  normal  0.15907 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0804  hypothetical protein  34.04 
 
 		 946 aa  197  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.771937  normal  0.0719166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  28.54 
 
 		 4071 aa  119  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  28.11 
 
 		 2833 aa  113  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5230  PKD domain containing protein  26.97 
 
 		 1222 aa  112  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.172686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  27.85 
 
 		 688 aa  108  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  28.65 
 
 		 938 aa  105  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2460  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1488 aa  103  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0925327 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2463  UDP-N-acetylglucosamine enolpyruvyl transferase  44.54 
 
 		 1140 aa  95.5  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1902  hypothetical protein  27.54 
 
 		 797 aa  94.4  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4711  hypothetical protein  40 
 
 		 890 aa  92.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220358  normal  0.108301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1910  hypothetical protein  25.05 
 
 		 541 aa  89  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.544837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04505  surface adhesion protein, putative  25.93 
 
 		 1345 aa  79.3  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  25.17 
 
 		 815 aa  77.4  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1043  hypothetical protein  26.32 
 
 		 636 aa  76.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.234332  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  36.44 
 
 		 1230 aa  76.3  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  25.61 
 
 		 1987 aa  75.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  24.76 
 
 		 650 aa  73.9  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  32.92 
 
 		 1228 aa  72.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  33.58 
 
 		 1606 aa  72.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6940  PKD domain containing protein  38.71 
 
 		 642 aa  72  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.811301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5863  Cadherin  33.33 
 
 		 3227 aa  71.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.510613 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3426  hypothetical protein  26.29 
 
 		 496 aa  70.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6939  PKD domain containing protein  34.43 
 
 		 886 aa  69.7  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.105874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  36.26 
 
 		 915 aa  68.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  32.58 
 
 		 1466 aa  67.8  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5801  hypothetical protein  38.46 
 
 		 503 aa  67.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1331 aa  65.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1976 aa  65.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2962  hypothetical protein  34.65 
 
 		 1287 aa  66.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000101411  unclonable  0.000000000000192663 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  28.81 
 
 		 2270 aa  66.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  25.06 
 
 		 799 aa  66.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2484  hypothetical protein  28.64 
 
 		 532 aa  65.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.480265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  33.08 
 
 		 1620 aa  65.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6385  hypothetical protein  40.66 
 
 		 694 aa  64.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.275393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4743  hypothetical protein  31.25 
 
 		 540 aa  64.3  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131887  hitchhiker  0.00231582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1738  PKD domain containing protein  37.63 
 
 		 2972 aa  63.9  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2195  PKD domain containing protein  43.94 
 
 		 2980 aa  63.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000175311 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  37.59 
 
 		 3324 aa  63.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5234  conserved repeat domain protein  32.41 
 
 		 885 aa  62  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.634416  hitchhiker  0.0000191517 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3752  hypothetical protein  33.82 
 
 		 490 aa  62  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6088  hypothetical protein  29.77 
 
 		 535 aa  61.6  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5691  PKD domain containing protein  28.28 
 
 		 662 aa  60.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2904  hypothetical protein  31.15 
 
 		 677 aa  60.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  30.23 
 
 		 3542 aa  59.3  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  30.77 
 
 		 1602 aa  59.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2587  hypothetical protein  39.56 
 
 		 652 aa  58.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0216608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  28.08 
 
 		 1288 aa  56.6  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  24.07 
 
 		 792 aa  56.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2674  hypothetical protein  34.83 
 
 		 640 aa  56.2  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  32.52 
 
 		 4896 aa  56.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4506  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1163 aa  55.5  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.521231 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4794  hypothetical protein  39.73 
 
 		 429 aa  53.5  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0109518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4004  hypothetical protein  29.84 
 
 		 598 aa  53.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  32.97 
 
 		 4429 aa  52.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1123  PKD domain-containing protein  26.26 
 
 		 1097 aa  52.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1035  hypothetical protein  28.04 
 
 		 496 aa  52.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000319911 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2353  hypothetical protein  29.35 
 
 		 534 aa  52.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.992213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1798  hypothetical protein  20.86 
 
 		 749 aa  52  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4003  hypothetical protein  35.62 
 
 		 658 aa  52  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5608  hypothetical protein  25.49 
 
 		 808 aa  51.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.406327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2925  hypothetical protein  29.34 
 
 		 561 aa  51.2  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000000182074  normal  0.28317 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  25.31 
 
 		 2421 aa  51.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  37.93 
 
 		 676 aa  50.8  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  22.22 
 
 		 1162 aa  50.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  22.4 
 
 		 2278 aa  50.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2094  outer membrane adhesin like proteiin  27.25 
 
 		 1428 aa  49.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3916  hypothetical protein  32.95 
 
 		 967 aa  49.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0844847 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  23.67 
 
 		 1547 aa  49.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  30.77 
 
 		 2377 aa  49.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  30.77 
 
 		 3793 aa  48.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  27.14 
 
 		 3927 aa  48.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3205  hypothetical protein  27.78 
 
 		 627 aa  48.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  26.08 
 
 		 1980 aa  48.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2924  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1064 aa  48.5  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000594804  normal  0.19757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  31.11 
 
 		 2927 aa  47.8  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3967  hypothetical protein  28 
 
 		 950 aa  47.8  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000017261  normal  0.368217 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  26.4 
 
 		 5544 aa  47.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  33.6 
 
 		 794 aa  47.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2689  hypothetical protein  32.8 
 
 		 637 aa  47  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>