36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0839 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0834  CHU large protein  56.27 
 
 
909 aa  670    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0835  hypothetical protein  59.8 
 
 
1084 aa  696    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0837  hypothetical protein  49.68 
 
 
1184 aa  683    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0838  hypothetical protein  71.31 
 
 
1046 aa  868    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  100 
 
 
1331 aa  2623    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  50 
 
 
2416 aa  595  1e-168  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4916  hypothetical protein  28.8 
 
 
2650 aa  152  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0873  CHU large protein  29.36 
 
 
1053 aa  146  3e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.539179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0878  hypothetical protein  29.17 
 
 
1051 aa  145  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.599854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0808  D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin  26.05 
 
 
1436 aa  99.8  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0805  hypothetical protein  28.37 
 
 
1021 aa  83.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265346  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0806  hypothetical protein  27.68 
 
 
1351 aa  83.2  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  47.75 
 
 
1452 aa  82.4  0.00000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  38.63 
 
 
1223 aa  77.4  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1906  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  34.2 
 
 
3682 aa  66.6  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0155813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  41.94 
 
 
915 aa  63.2  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0803  hypothetical protein  23.28 
 
 
1114 aa  59.3  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  24.25 
 
 
3324 aa  56.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  40.19 
 
 
2367 aa  56.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  40.19 
 
 
2411 aa  56.2  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  37.96 
 
 
2454 aa  54.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  37.96 
 
 
2421 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  37.04 
 
 
2807 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0183  putative lipoprotein  24.76 
 
 
2204 aa  53.9  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0220  hypothetical protein  33.78 
 
 
948 aa  53.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000317657  normal  0.15907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  44.44 
 
 
4978 aa  52.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  48.1 
 
 
1332 aa  52  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2985  hypothetical protein  30.37 
 
 
667 aa  52  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000400495  hitchhiker  0.00618409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  41.38 
 
 
891 aa  51.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1557  hypothetical protein  39.47 
 
 
3851 aa  49.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  24.66 
 
 
1083 aa  48.9  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  22.61 
 
 
1280 aa  48.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1688  hypothetical protein  28.09 
 
 
1313 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  36.92 
 
 
1657 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1634  hypothetical protein  36.27 
 
 
1245 aa  46.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.070583  decreased coverage  0.00112421 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  34.48 
 
 
976 aa  46.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>