91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0961 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  100 
 
 		 1452 aa  2909    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03428  hypothetical protein  39.18 
 
 		 579 aa  414  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002581  glucosamine-link cellobiase  38.66 
 
 		 579 aa  393  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2581  putative chitobiase (exoglucosidase)  38.97 
 
 		 575 aa  389  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0144  endoglucanase-related protein  38.61 
 
 		 574 aa  381  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0843  glycoside hydrolase family 9  39.32 
 
 		 559 aa  379  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  42.65 
 
 		 2416 aa  372  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5748  glycoside hydrolase family 9  36.99 
 
 		 613 aa  346  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.843409  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0426  glycoside hydrolase family protein  36.12 
 
 		 613 aa  340  9e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  40.49 
 
 		 1223 aa  335  4e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4776  glycosy hydrolase family protein  35.14 
 
 		 606 aa  330  2.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.520076  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0525  glycoside hydrolase family 9  37.38 
 
 		 609 aa  323  1.9999999999999998e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0837  hypothetical protein  39.58 
 
 		 1184 aa  141  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  31.11 
 
 		 854 aa  105  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  36.19 
 
 		 1331 aa  86.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3105  hypothetical protein  29.76 
 
 		 787 aa  82.4  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.667845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  37.44 
 
 		 1288 aa  73.6  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  25.41 
 
 		 1076 aa  72  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  29.24 
 
 		 1565 aa  68.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1279  hypothetical protein  26.45 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.592853  normal  0.21941 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  23.58 
 
 		 1523 aa  65.1  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  24.88 
 
 		 859 aa  63.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  25.2 
 
 		 621 aa  63.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  30.05 
 
 		 775 aa  62.4  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3077  hypothetical protein  31.09 
 
 		 673 aa  61.6  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  25.82 
 
 		 976 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  35.9 
 
 		 972 aa  59.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  26.98 
 
 		 953 aa  59.3  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.9 
 
 		 998 aa  58.5  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  42.99 
 
 		 816 aa  57.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  53.33 
 
 		 1332 aa  56.2  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  36.63 
 
 		 915 aa  55.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  33.85 
 
 		 675 aa  55.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  30.28 
 
 		 1150 aa  55.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  27.33 
 
 		 3793 aa  55.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  26.82 
 
 		 752 aa  55.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2851  hypothetical protein  29.5 
 
 		 623 aa  54.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948008  normal  0.0502598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  21.93 
 
 		 1601 aa  54.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  32.48 
 
 		 918 aa  54.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  32.72 
 
 		 1474 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0638  PKD domain-containing protein  47.06 
 
 		 519 aa  53.9  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  31.32 
 
 		 1002 aa  52.8  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  29.55 
 
 		 581 aa  53.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  34.35 
 
 		 2122 aa  53.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  27 
 
 		 1969 aa  53.1  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  37.36 
 
 		 1528 aa  52.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  32.46 
 
 		 1916 aa  51.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  26.29 
 
 		 833 aa  51.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  24.61 
 
 		 2272 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  30.34 
 
 		 940 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  37.72 
 
 		 547 aa  51.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  22.49 
 
 		 864 aa  51.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  34.71 
 
 		 677 aa  50.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  41.98 
 
 		 971 aa  50.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  31.85 
 
 		 1585 aa  50.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  31.07 
 
 		 1247 aa  49.7  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2209  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.14 
 
 		 1158 aa  49.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00262816  normal  0.214533 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  33.09 
 
 		 2036 aa  49.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  46.91 
 
 		 561 aa  49.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  38.89 
 
 		 1120 aa  49.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  32.33 
 
 		 1217 aa  48.9  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  33.33 
 
 		 2000 aa  49.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  42.05 
 
 		 2066 aa  48.5  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  25.08 
 
 		 978 aa  48.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  28.85 
 
 		 679 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  34.26 
 
 		 1057 aa  47.8  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  28.46 
 
 		 4231 aa  47  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  26.69 
 
 		 591 aa  47.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1329 aa  47  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  25.51 
 
 		 775 aa  47.8  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  34.65 
 
 		 1969 aa  47  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.54 
 
 		 762 aa  47  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1806  cellulosome enzyme, dockerin type I  29.41 
 
 		 2177 aa  46.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  31.76 
 
 		 1620 aa  47  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  32.5 
 
 		 184 aa  47  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  26.07 
 
 		 1292 aa  46.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  24.37 
 
 		 739 aa  46.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  35.24 
 
 		 936 aa  46.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  38.27 
 
 		 1882 aa  45.8  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  35.24 
 
 		 936 aa  46.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  26.05 
 
 		 815 aa  45.8  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.68 
 
 		 3699 aa  45.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  35.58 
 
 		 1682 aa  45.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  26.11 
 
 		 735 aa  45.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  31.65 
 
 		 938 aa  45.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  35 
 
 		 1300 aa  45.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  38.04 
 
 		 669 aa  45.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  30.63 
 
 		 1135 aa  45.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  26.97 
 
 		 665 aa  45.1  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  43 
 
 		 780 aa  45.1  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  34.75 
 
 		 1842 aa  45.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>