23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0144 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002581  glucosamine-link cellobiase  69.72 
 
 		 579 aa  838    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0144  endoglucanase-related protein  100 
 
 		 574 aa  1205    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03428  hypothetical protein  68.84 
 
 		 579 aa  853    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2581  putative chitobiase (exoglucosidase)  67.31 
 
 		 575 aa  793    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0843  glycoside hydrolase family 9  46.29 
 
 		 559 aa  499  1e-140  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0426  glycoside hydrolase family protein  41.81 
 
 		 613 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5748  glycoside hydrolase family 9  43.1 
 
 		 613 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.843409  normal  0.419471 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0525  glycoside hydrolase family 9  44.29 
 
 		 609 aa  432  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  38.61 
 
 		 1452 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4776  glycosy hydrolase family protein  33.51 
 
 		 606 aa  317  3e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.520076  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  24.09 
 
 		 1601 aa  60.1  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  27.83 
 
 		 815 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  23.83 
 
 		 1224 aa  51.2  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.18 
 
 		 998 aa  50.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  29.83 
 
 		 739 aa  50.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  26 
 
 		 875 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  25.59 
 
 		 665 aa  47.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  29.34 
 
 		 851 aa  47.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  26.38 
 
 		 1076 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  24.26 
 
 		 762 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0076  glycoside hydrolase family 9  30.08 
 
 		 837 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  24.23 
 
 		 621 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  25.73 
 
 		 775 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>