265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0787 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  100 
 
 
561 aa  1083    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  37.88 
 
 
497 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  34.81 
 
 
432 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  31.35 
 
 
684 aa  119  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  32.96 
 
 
435 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  30.89 
 
 
963 aa  118  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  30.38 
 
 
600 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2495  PEGA  27.49 
 
 
436 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.441491  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2498  PKD  32.2 
 
 
465 aa  99.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000170724  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  30.97 
 
 
460 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  59.52 
 
 
941 aa  98.2  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  61.73 
 
 
996 aa  97.4  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  52 
 
 
1282 aa  96.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  59.04 
 
 
1667 aa  95.5  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  55.17 
 
 
1094 aa  92  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  51 
 
 
528 aa  92  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  58.02 
 
 
2122 aa  91.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  57.83 
 
 
1361 aa  91.7  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  50 
 
 
1682 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  53.26 
 
 
1931 aa  90.5  8e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.21259 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  53.75 
 
 
547 aa  90.1  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2179  hypothetical protein  37.63 
 
 
323 aa  90.1  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  52.81 
 
 
675 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  54.22 
 
 
1969 aa  89.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  51.76 
 
 
1120 aa  89.4  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  31.09 
 
 
456 aa  88.6  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  42.96 
 
 
735 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  53.57 
 
 
581 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  48.04 
 
 
669 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  54.76 
 
 
1300 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  51.25 
 
 
551 aa  89.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  57.32 
 
 
1236 aa  89.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  53.75 
 
 
575 aa  88.6  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  55 
 
 
2036 aa  88.2  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  54.43 
 
 
2000 aa  88.2  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  49.4 
 
 
791 aa  88.2  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  53.93 
 
 
3295 aa  87.8  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  49.06 
 
 
1830 aa  87.4  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  53.75 
 
 
644 aa  87.8  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  56.63 
 
 
2554 aa  87.8  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  50.62 
 
 
713 aa  87.4  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  53.75 
 
 
2272 aa  87.4  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  55.42 
 
 
848 aa  87.4  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  54.88 
 
 
1356 aa  87.4  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  50.62 
 
 
978 aa  87.4  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  49.41 
 
 
184 aa  87.4  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  54.88 
 
 
859 aa  87.4  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  53.75 
 
 
1882 aa  87  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  51.25 
 
 
679 aa  87  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  51.85 
 
 
560 aa  86.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  45.28 
 
 
615 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  52.5 
 
 
561 aa  86.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  47.12 
 
 
1862 aa  86.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  52.04 
 
 
1732 aa  85.9  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  30.57 
 
 
456 aa  85.9  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  51.81 
 
 
658 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  52.5 
 
 
1842 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  47.97 
 
 
460 aa  85.5  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  59.49 
 
 
439 aa  84.7  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  53.75 
 
 
1241 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  47.62 
 
 
530 aa  84  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  51.35 
 
 
685 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1686  periplasmic copper-binding  46.81 
 
 
1056 aa  83.6  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482609  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1135  hypothetical protein  52.94 
 
 
225 aa  83.6  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  51.25 
 
 
752 aa  83.6  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  35.89 
 
 
816 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  48.75 
 
 
769 aa  82  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  30.8 
 
 
326 aa  82  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  33.77 
 
 
211 aa  81.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2071  Carbohydrate binding family 6  54.43 
 
 
1380 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.306385  normal  0.362656 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  34.9 
 
 
1528 aa  81.3  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  32.86 
 
 
546 aa  80.5  0.00000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  53.66 
 
 
930 aa  80.5  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  53.75 
 
 
910 aa  80.9  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  55.84 
 
 
930 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0865  hydrogenobyrinic acid a,c-diamide cobaltochelatase  49.4 
 
 
2065 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  44.83 
 
 
958 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  58.33 
 
 
971 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  51.95 
 
 
869 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  48.1 
 
 
719 aa  78.2  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  52.44 
 
 
1783 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  48.75 
 
 
1231 aa  77.8  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  50 
 
 
838 aa  77.4  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2499  PKD  37.76 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00083014  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  50.63 
 
 
786 aa  77.4  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  50 
 
 
1328 aa  77  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  53.01 
 
 
1531 aa  77  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  44.83 
 
 
1001 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  48.65 
 
 
500 aa  76.6  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  47.06 
 
 
845 aa  75.5  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0134  hypothetical protein  32.89 
 
 
412 aa  76.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0417  PKD  58.06 
 
 
582 aa  76.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.441359 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  48.81 
 
 
1667 aa  75.1  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  49.37 
 
 
777 aa  75.1  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  48.81 
 
 
938 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  49.37 
 
 
861 aa  75.1  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  49.37 
 
 
823 aa  75.1  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2929  surface layer protein B  48.35 
 
 
471 aa  74.7  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0075773  hitchhiker  0.00586153 
 
 
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NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  39.73 
 
 
1096 aa  74.7  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
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NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  47.19 
 
 
870 aa  74.7  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
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