65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0214 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  845    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  31.37 
 
 
600 aa  209  8e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  34.7 
 
 
432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  31.89 
 
 
460 aa  169  9e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2495  PEGA  29.84 
 
 
436 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.441491  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  33.77 
 
 
684 aa  164  3e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  36.27 
 
 
497 aa  163  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  35.89 
 
 
456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  35.89 
 
 
456 aa  133  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  30.28 
 
 
727 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  33.24 
 
 
561 aa  110  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  33.72 
 
 
409 aa  106  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  30.67 
 
 
546 aa  104  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  25 
 
 
613 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  37.11 
 
 
426 aa  99.8  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  29.36 
 
 
412 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0772  hypothetical protein  28.62 
 
 
335 aa  92.8  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133586  normal  0.240825 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.96 
 
 
1085 aa  92  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  29.78 
 
 
963 aa  89.4  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2300  PEGA  29.18 
 
 
311 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0134  hypothetical protein  30.05 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  35.47 
 
 
1096 aa  80.5  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  25.64 
 
 
750 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2682  serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 
752 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  34.94 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  31.41 
 
 
416 aa  71.2  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2302  hypothetical protein  25.4 
 
 
271 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2301  hypothetical protein  32.69 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1562  PEGA domain protein  26.6 
 
 
533 aa  63.2  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00305043  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2317  PEGA domain-containing protein  42.53 
 
 
379 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1197  PEGA domain-containing protein  30.82 
 
 
364 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  hitchhiker  0.00873035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  24.68 
 
 
1189 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0016  hypothetical protein  28.57 
 
 
553 aa  57  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.697123  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5102  serine/threonine protein kinase  25.33 
 
 
629 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.916534 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0814  PEGA domain-containing protein  36.19 
 
 
341 aa  55.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1453  PEGA domain-containing protein  32 
 
 
276 aa  54.3  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0637995  normal  0.0741839 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  35.63 
 
 
930 aa  54.7  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5122  type IV pilus assembly PilZ  32.59 
 
 
843 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0427193  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0335  PEGA domain-containing protein  44.93 
 
 
226 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03503  Secreted protein with uncharacterized domain  28.19 
 
 
660 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0116  PEGA domain-containing protein  32.1 
 
 
310 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  37.29 
 
 
211 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5101  serine/threonine protein kinase  23.58 
 
 
996 aa  51.2  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4431  PEGA domain-containing protein  39.34 
 
 
283 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.373808  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  25.95 
 
 
601 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0992  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
774 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2179  hypothetical protein  28.43 
 
 
323 aa  48.9  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0483  PEGA  41.27 
 
 
118 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6069  serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 
883 aa  47.8  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.249912  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2741  PEGA domain protein  28.44 
 
 
597 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0079  PEGA domain-containing protein  32.31 
 
 
247 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0262  serine/threonine protein kinase  29.01 
 
 
806 aa  47  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297751  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2676  serine/threonine protein kinase  23.11 
 
 
769 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.282843 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1066  PEGA  36.84 
 
 
170 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0186705  normal  0.156547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1818  PEGA domain protein  24.48 
 
 
592 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4224  serine/threonine protein kinase  30.43 
 
 
925 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.674514  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4011  PEGA domain protein  28.46 
 
 
438 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0496099  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0068  hypothetical protein  28.64 
 
 
394 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000118188 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1219  hypothetical protein  27.68 
 
 
586 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0105779  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2575  hypothetical protein  21.95 
 
 
401 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000914091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2480  hypothetical protein  33.33 
 
 
364 aa  44.3  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0575  PEGA domain-containing protein  32.76 
 
 
269 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.416846  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0552  hypothetical protein  24.58 
 
 
464 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.092492  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2294  hypothetical protein  25.49 
 
 
313 aa  43.5  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1640  PEGA domain-containing protein  31.75 
 
 
265 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>