59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3001 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  100 
 
 
600 aa  1200    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  39.28 
 
 
432 aa  232  2e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  31.37 
 
 
435 aa  209  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2495  PEGA  28.43 
 
 
436 aa  182  1e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.441491  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  32.65 
 
 
460 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  29.81 
 
 
497 aa  162  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  39.32 
 
 
546 aa  159  1e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  28.27 
 
 
684 aa  157  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  28.12 
 
 
727 aa  117  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0772  hypothetical protein  29.43 
 
 
335 aa  114  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133586  normal  0.240825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  30.38 
 
 
561 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  24.34 
 
 
613 aa  100  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0134  hypothetical protein  31.96 
 
 
412 aa  100  9e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  33.78 
 
 
409 aa  97.8  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2682  serine/threonine protein kinase  28.92 
 
 
752 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2302  hypothetical protein  33.53 
 
 
271 aa  86.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  27.6 
 
 
456 aa  86.7  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  27.65 
 
 
456 aa  81.6  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0035  hypothetical protein  29.28 
 
 
520 aa  77  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  33.33 
 
 
426 aa  77.4  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 
750 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  25.4 
 
 
963 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2300  PEGA  28.38 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  29.03 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  37.24 
 
 
1096 aa  71.2  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  32.09 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.95 
 
 
1085 aa  68.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2179  hypothetical protein  30.65 
 
 
323 aa  67.8  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257809  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1135  hypothetical protein  26.37 
 
 
225 aa  63.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2317  PEGA domain-containing protein  40.32 
 
 
379 aa  59.3  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2301  hypothetical protein  28.67 
 
 
219 aa  58.9  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0079  PEGA domain-containing protein  38.46 
 
 
247 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0116  PEGA domain-containing protein  36.67 
 
 
310 aa  57.4  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1438  hypothetical protein  37.11 
 
 
184 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00281988  hitchhiker  0.000303146 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  35.62 
 
 
930 aa  55.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4431  PEGA domain-containing protein  41.38 
 
 
283 aa  55.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.373808  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  26.94 
 
 
1189 aa  54.3  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  25.55 
 
 
416 aa  53.9  0.000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2676  serine/threonine protein kinase  25.82 
 
 
769 aa  51.6  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.282843 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  39.02 
 
 
823 aa  51.2  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  42.86 
 
 
211 aa  51.2  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1967  hypothetical protein  27.81 
 
 
208 aa  50.8  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0262  serine/threonine protein kinase  25.17 
 
 
806 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.297751  normal  0.690311 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0335  PEGA domain-containing protein  38.24 
 
 
226 aa  49.3  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0016  hypothetical protein  23.78 
 
 
553 aa  49.7  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2294  hypothetical protein  32.98 
 
 
313 aa  49.3  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03503  Secreted protein with uncharacterized domain  21.32 
 
 
660 aa  48.9  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0986  serine/threonine protein kinase  38.24 
 
 
554 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182667  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0814  PEGA domain-containing protein  24.63 
 
 
341 aa  48.5  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1453  PEGA domain-containing protein  33.66 
 
 
276 aa  47.8  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0637995  normal  0.0741839 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0483  PEGA  36.99 
 
 
118 aa  47.4  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  36.59 
 
 
802 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0992  serine/threonine protein kinase  37.31 
 
 
774 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1528  serine/threonine protein kinase  23.98 
 
 
601 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1197  PEGA domain-containing protein  26.37 
 
 
364 aa  46.2  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  hitchhiker  0.00873035 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0575  PEGA domain-containing protein  28.57 
 
 
269 aa  45.8  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.416846  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1562  PEGA domain protein  24.1 
 
 
533 aa  45.1  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00305043  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2225  serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
681 aa  44.3  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.297474 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2499  PKD  38.71 
 
 
374 aa  43.9  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00083014  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>