27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0335 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0335  PEGA domain-containing protein  100 
 
 
226 aa  430  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  43.37 
 
 
684 aa  67.8  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  42.11 
 
 
460 aa  62.4  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  41.94 
 
 
326 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2495  PEGA  41.43 
 
 
436 aa  58.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.441491  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2317  PEGA domain-containing protein  36.42 
 
 
379 aa  57  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  48.98 
 
 
497 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  31.06 
 
 
727 aa  55.8  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  45.07 
 
 
435 aa  54.3  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  48.21 
 
 
432 aa  53.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.03 
 
 
1085 aa  52  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2300  PEGA  38.46 
 
 
311 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  38.57 
 
 
600 aa  50.4  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4431  PEGA domain-containing protein  45.76 
 
 
283 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.373808  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  33.33 
 
 
546 aa  49.3  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0116  PEGA domain-containing protein  40.38 
 
 
310 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2294  hypothetical protein  36.78 
 
 
313 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.769355 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  43.64 
 
 
211 aa  47  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0134  hypothetical protein  38.33 
 
 
412 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  38.71 
 
 
1096 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  36.99 
 
 
409 aa  44.7  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  34.29 
 
 
412 aa  43.9  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  42.86 
 
 
561 aa  43.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0847  hypothetical protein  38.89 
 
 
134 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.104899  normal  0.523953 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1497  NirV precursor  27.52 
 
 
387 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0186201  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2302  hypothetical protein  34.55 
 
 
271 aa  42.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2301  hypothetical protein  37.21 
 
 
219 aa  41.6  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>