26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0847 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0847  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  274  2e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.104899  normal  0.523953 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2532  conserved hypothetical protein; putative conserved domain  57.25 
 
 
157 aa  169  9e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165236  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2566  hypothetical protein  38.39 
 
 
171 aa  70.1  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.237143  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1247  hypothetical protein  30.83 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0726  putative lipoprotein  36.36 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7183  translation initiation factor 2 GTPase  34.91 
 
 
192 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747071  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2475  hypothetical protein  34.34 
 
 
312 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000341463  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2550  hypothetical protein  32.65 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2821  hypothetical protein  32.65 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0637274  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0669  hypothetical protein  35.65 
 
 
163 aa  49.7  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000157853  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3745  hypothetical protein  29.52 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4764  hypothetical protein  29.73 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0362  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  31.37 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.994449  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2921  hypothetical protein  32.65 
 
 
147 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0884  hypothetical protein  28.71 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.119116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0844  hypothetical protein  28.71 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  decreased coverage  0.00416761 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0335  PEGA domain-containing protein  38.89 
 
 
226 aa  44.7  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4431  PEGA domain-containing protein  34.07 
 
 
283 aa  44.3  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.373808  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1934  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  28.71 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.30886  normal  0.0103146 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0810  hypothetical protein  26.73 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.0921334 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  41.18 
 
 
326 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1208  hypothetical protein  37.7 
 
 
254 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  42.55 
 
 
432 aa  41.6  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0357  hypothetical protein  27.45 
 
 
153 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.453478  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2938  hypothetical protein  27.88 
 
 
224 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1527  serine/threonine protein kinase  39.66 
 
 
1122 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>