27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3745 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3745  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  315  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0362  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  48.41 
 
 		 143 aa  121  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.994449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0810  hypothetical protein  54.13 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.0921334 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1934  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  57.39 
 
 		 126 aa  114  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.30886  normal  0.0103146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0357  hypothetical protein  45.24 
 
 		 153 aa  113  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.453478  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7183  translation initiation factor 2 GTPase  56.25 
 
 		 192 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4764  hypothetical protein  48.21 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0884  hypothetical protein  56.03 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2921  hypothetical protein  46.04 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2550  hypothetical protein  49.57 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3077  hypothetical protein  41.26 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00471105  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0844  hypothetical protein  54.31 
 
 		 144 aa  101  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  decreased coverage  0.00416761 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2821  hypothetical protein  48.21 
 
 		 150 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0637274  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2532  conserved hypothetical protein; putative conserved domain  30.56 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165236  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1247  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  56.6  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0847  hypothetical protein  30.48 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.104899  normal  0.523953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2566  hypothetical protein  30 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.237143  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1702  hypothetical membrane associated protein  31.16 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.641444  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0487  putative lipoprotein  31.16 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.266885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1478  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2192  hypothetical protein  36.49 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2475  hypothetical protein  29.73 
 
 		 312 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000341463  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3481  hypothetical protein  42.31 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2074  hypothetical protein  28.57 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.560807  normal  0.465061 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1208  hypothetical protein  31.93 
 
 		 254 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2053  hypothetical protein  36.99 
 
 		 153 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.201224 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 		 750 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>