21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1934 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1934  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  100 
 
 		 126 aa  251  3e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.30886  normal  0.0103146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0362  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  50.41 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.994449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7183  translation initiation factor 2 GTPase  63.03 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747071  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3745  hypothetical protein  57.39 
 
 		 158 aa  114  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0810  hypothetical protein  45.79 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.0921334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0844  hypothetical protein  46.73 
 
 		 144 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  decreased coverage  0.00416761 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0357  hypothetical protein  35.29 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.453478  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0884  hypothetical protein  46.73 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119116 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4764  hypothetical protein  41.23 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2921  hypothetical protein  42.15 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2550  hypothetical protein  42.15 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2821  hypothetical protein  44.25 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0637274  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3077  hypothetical protein  34.45 
 
 		 157 aa  76.6  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00471105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2532  conserved hypothetical protein; putative conserved domain  29.46 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165236  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2566  hypothetical protein  31.3 
 
 		 171 aa  53.9  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.237143  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1247  hypothetical protein  31.62 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0847  hypothetical protein  29.7 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.104899  normal  0.523953 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1208  hypothetical protein  32.28 
 
 		 254 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1702  hypothetical membrane associated protein  30.77 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.641444  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0487  putative lipoprotein  32.71 
 
 		 140 aa  40  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.266885  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2192  hypothetical protein  38.37 
 
 		 149 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>