15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1208 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1208  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0487  putative lipoprotein  46.28 
 
 		 140 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.266885  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1702  hypothetical membrane associated protein  45.45 
 
 		 140 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.641444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0027  putative secreted protein  36.55 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2475  hypothetical protein  34.21 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000341463  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2921  hypothetical protein  32.33 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2550  hypothetical protein  33.08 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2821  hypothetical protein  33.9 
 
 		 150 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0637274  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2566  hypothetical protein  33.62 
 
 		 171 aa  50.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.237143  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4764  hypothetical protein  31.36 
 
 		 153 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0357  hypothetical protein  30.08 
 
 		 153 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.453478  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2532  conserved hypothetical protein; putative conserved domain  33.01 
 
 		 157 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165236  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7183  translation initiation factor 2 GTPase  30.28 
 
 		 192 aa  42.4  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747071  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0847  hypothetical protein  37.7 
 
 		 134 aa  42.4  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.104899  normal  0.523953 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1247  hypothetical protein  31.3 
 
 		 169 aa  42  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>