25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4764 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4764  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  299  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2921  hypothetical protein  65.08 
 
 
147 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2550  hypothetical protein  64.29 
 
 
149 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2821  hypothetical protein  67.57 
 
 
150 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0637274  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0810  hypothetical protein  53.57 
 
 
144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.0921334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0362  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  44.83 
 
 
143 aa  100  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.994449  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0884  hypothetical protein  54.05 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.119116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0844  hypothetical protein  53.15 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  decreased coverage  0.00416761 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3745  hypothetical protein  44.44 
 
 
158 aa  95.5  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0357  hypothetical protein  46.4 
 
 
153 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.453478  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3077  hypothetical protein  41.6 
 
 
157 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00471105  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7183  translation initiation factor 2 GTPase  43.09 
 
 
192 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747071  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1934  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  40 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.30886  normal  0.0103146 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1702  hypothetical membrane associated protein  29.91 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.641444  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0487  putative lipoprotein  29.91 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.266885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2566  hypothetical protein  32.39 
 
 
171 aa  50.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.237143  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1208  hypothetical protein  29.55 
 
 
254 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2532  conserved hypothetical protein; putative conserved domain  30.09 
 
 
157 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165236  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0847  hypothetical protein  30.36 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.104899  normal  0.523953 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3024  hypothetical protein  28.15 
 
 
226 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.836248  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2475  hypothetical protein  31.75 
 
 
312 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000341463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3131  hypothetical protein  27.21 
 
 
227 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.178053  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3855  hypothetical protein  29.03 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2938  hypothetical protein  27.19 
 
 
224 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1247  hypothetical protein  31.5 
 
 
169 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>