14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1247 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1247  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  347  6e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2566  hypothetical protein  43.23 
 
 
171 aa  138  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.237143  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2475  hypothetical protein  45.95 
 
 
312 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000341463  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0669  hypothetical protein  40.29 
 
 
163 aa  95.9  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000157853  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0847  hypothetical protein  30.83 
 
 
134 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.104899  normal  0.523953 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0019  hypothetical protein  32.84 
 
 
126 aa  56.2  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3745  hypothetical protein  32.67 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2532  conserved hypothetical protein; putative conserved domain  30.83 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165236  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2921  hypothetical protein  29.5 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2550  hypothetical protein  29.5 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1702  hypothetical membrane associated protein  26.15 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.641444  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0487  putative lipoprotein  26.15 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.266885  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1208  hypothetical protein  31.9 
 
 
254 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0362  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  28.35 
 
 
143 aa  40.8  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.994449  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>