17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0362 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0362  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  100 
 
 
143 aa  287  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.994449  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1934  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  50.41 
 
 
126 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.30886  normal  0.0103146 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7183  translation initiation factor 2 GTPase  47.97 
 
 
192 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747071  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3745  hypothetical protein  48.41 
 
 
158 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0810  hypothetical protein  47.32 
 
 
144 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.0921334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4764  hypothetical protein  45.22 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0884  hypothetical protein  46.43 
 
 
144 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.119116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0844  hypothetical protein  46.43 
 
 
144 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  decreased coverage  0.00416761 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2921  hypothetical protein  44.07 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2550  hypothetical protein  44.07 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3077  hypothetical protein  41.96 
 
 
157 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00471105  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0357  hypothetical protein  39.39 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.453478  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2821  hypothetical protein  43.24 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0637274  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2532  conserved hypothetical protein; putative conserved domain  29.91 
 
 
157 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165236  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0847  hypothetical protein  31.37 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.104899  normal  0.523953 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2566  hypothetical protein  29.6 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.237143  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1247  hypothetical protein  28.35 
 
 
169 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>