38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2475 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2475  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000341463  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0669  hypothetical protein  45.93 
 
 		 163 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000157853  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1247  hypothetical protein  42.86 
 
 		 169 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2566  hypothetical protein  39.5 
 
 		 171 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.237143  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1702  hypothetical membrane associated protein  33.82 
 
 		 140 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.641444  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0487  putative lipoprotein  33.09 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.266885  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0323  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 212 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00135307  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2532  conserved hypothetical protein; putative conserved domain  33.64 
 
 		 157 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165236  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1208  hypothetical protein  32.26 
 
 		 254 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3450  adenylate/guanylate cyclase  23.39 
 
 		 652 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1746  hypothetical protein  24.62 
 
 		 614 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000631337  hitchhiker  0.00120069 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0847  hypothetical protein  34.34 
 
 		 134 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.104899  normal  0.523953 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3947  membrane lipoprotein lipid attachment site  30.58 
 
 		 200 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191679  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1695  hypothetical protein  33.98 
 
 		 332 aa  49.7  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2490  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  23.44 
 
 		 738 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  21.31 
 
 		 622 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3337  putative adenylate cyclase  25.69 
 
 		 686 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1942  TPR repeat-containing protein  21.02 
 
 		 626 aa  47.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  21.31 
 
 		 622 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.43 
 
 		 769 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0861  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 580 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2276  transcriptional regulatory protein-like  23.78 
 
 		 522 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3644  curli production assembly/transport component CsgG  31.11 
 
 		 340 aa  46.2  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.8014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2921  hypothetical protein  35.29 
 
 		 147 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0824  membrane lipoprotein lipid attachment site  28.89 
 
 		 201 aa  45.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.525373  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2550  hypothetical protein  35.04 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  22.46 
 
 		 634 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4764  hypothetical protein  31.01 
 
 		 153 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 		 597 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  23.13 
 
 		 945 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0770  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.57 
 
 		 757 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.424396 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3419  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  20.61 
 
 		 723 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0968  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 584 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0964  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.67 
 
 		 197 aa  43.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0219897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1118  transcriptional regulator  21.43 
 
 		 518 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0836  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.67 
 
 		 197 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0143317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1184  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  20.45 
 
 		 631 aa  42.4  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0019  hypothetical protein  29.41 
 
 		 126 aa  42.4  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>