27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0844 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0844  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  287  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  decreased coverage  0.00416761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0884  hypothetical protein  97.22 
 
 		 144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0810  hypothetical protein  86.81 
 
 		 144 aa  215  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.0921334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0362  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  47.46 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.994449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4764  hypothetical protein  53.15 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0357  hypothetical protein  47.62 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.453478  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2921  hypothetical protein  47.14 
 
 		 147 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3745  hypothetical protein  52.31 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2550  hypothetical protein  50 
 
 		 149 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2821  hypothetical protein  51.35 
 
 		 150 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0637274  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1934  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  46.77 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.30886  normal  0.0103146 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7183  translation initiation factor 2 GTPase  43.9 
 
 		 192 aa  90.5  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747071  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3077  hypothetical protein  43.22 
 
 		 157 aa  90.1  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00471105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2532  conserved hypothetical protein; putative conserved domain  29.31 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165236  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0847  hypothetical protein  29.7 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.104899  normal  0.523953 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1208  hypothetical protein  27.5 
 
 		 254 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2475  hypothetical protein  30.16 
 
 		 312 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000341463  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1478  hypothetical protein  39.02 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2192  hypothetical protein  37.04 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1247  hypothetical protein  31.15 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1702  hypothetical membrane associated protein  27.34 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.641444  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2566  hypothetical protein  25.81 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.237143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2053  hypothetical protein  37.84 
 
 		 153 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.201224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2074  hypothetical protein  47.06 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.560807  normal  0.465061 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0487  putative lipoprotein  29.25 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.266885  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3131  hypothetical protein  23.68 
 
 		 227 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.178053  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3024  hypothetical protein  23.68 
 
 		 226 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.836248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>