22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0357 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0357  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  307  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.453478  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3077  hypothetical protein  58.16 
 
 		 157 aa  144  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00471105  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0810  hypothetical protein  53.21 
 
 		 144 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.0921334 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3745  hypothetical protein  44.53 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0884  hypothetical protein  52.29 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0844  hypothetical protein  52.29 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  decreased coverage  0.00416761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4764  hypothetical protein  47.79 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2550  hypothetical protein  45 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2921  hypothetical protein  46.67 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2821  hypothetical protein  52.21 
 
 		 150 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0637274  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0362  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  39.39 
 
 		 143 aa  97.4  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.994449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1934  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  35.29 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.30886  normal  0.0103146 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7183  translation initiation factor 2 GTPase  38.94 
 
 		 192 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1208  hypothetical protein  31.45 
 
 		 254 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.775507  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1702  hypothetical membrane associated protein  28.57 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.641444  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0487  putative lipoprotein  29.91 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.266885  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2532  conserved hypothetical protein; putative conserved domain  25.45 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2475  hypothetical protein  30.09 
 
 		 312 aa  46.2  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000341463  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2566  hypothetical protein  30.58 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.237143  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0847  hypothetical protein  28.43 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.104899  normal  0.523953 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3024  hypothetical protein  26.72 
 
 		 226 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.836248  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3131  hypothetical protein  26.72 
 
 		 227 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.178053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>