19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0810 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0810  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.0921334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0844  hypothetical protein  86.81 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  decreased coverage  0.00416761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0884  hypothetical protein  86.81 
 
 		 144 aa  198  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0362  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  47.46 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.994449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0357  hypothetical protein  49.59 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.453478  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4764  hypothetical protein  53.57 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3745  hypothetical protein  53.28 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2921  hypothetical protein  48.89 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2550  hypothetical protein  52.17 
 
 		 149 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2821  hypothetical protein  52.25 
 
 		 150 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0637274  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3077  hypothetical protein  44.92 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00471105  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1934  translation initiation factor 2, gamma subunit, GTPase  44.54 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.30886  normal  0.0103146 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7183  translation initiation factor 2 GTPase  42.86 
 
 		 192 aa  86.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.747071  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2532  conserved hypothetical protein; putative conserved domain  26.72 
 
 		 157 aa  51.6  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000165236  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0847  hypothetical protein  26.73 
 
 		 134 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.104899  normal  0.523953 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1702  hypothetical membrane associated protein  26.4 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.641444  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1247  hypothetical protein  30.08 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193332  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0487  putative lipoprotein  25.6 
 
 		 140 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.266885  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1478  hypothetical protein  30.59 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>