29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4431 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4431  PEGA domain-containing protein  100 
 
 
283 aa  568  1e-161  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.373808  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0792  hypothetical protein  28.83 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.461993  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0079  PEGA domain-containing protein  52.46 
 
 
247 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  41.38 
 
 
600 aa  55.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0335  PEGA domain-containing protein  45.76 
 
 
226 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17440  hypothetical protein  25 
 
 
307 aa  50.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  39.34 
 
 
435 aa  49.7  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0116  PEGA domain-containing protein  32.89 
 
 
310 aa  50.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  31.51 
 
 
409 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2301  hypothetical protein  37.68 
 
 
219 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  40.3 
 
 
613 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  37.68 
 
 
684 aa  46.6  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.35 
 
 
1085 aa  45.8  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  32.84 
 
 
426 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  44.68 
 
 
497 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  32.84 
 
 
432 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1219  hypothetical protein  39.66 
 
 
586 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0105779  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0483  PEGA  32.81 
 
 
118 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0847  hypothetical protein  34.07 
 
 
134 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.104899  normal  0.523953 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1497  NirV precursor  40.38 
 
 
387 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0186201  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0167  hypothetical protein  27.85 
 
 
379 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000240644  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1249  hypothetical protein  31.16 
 
 
330 aa  43.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  40.98 
 
 
605 aa  43.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  38.18 
 
 
460 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2302  hypothetical protein  35.09 
 
 
271 aa  42.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1756  Carbohydrate binding family 6  39.19 
 
 
930 aa  42.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.127893  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2665  PEGA domain-containing protein  38.89 
 
 
267 aa  42.7  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  29.6 
 
 
727 aa  42  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  29.82 
 
 
307 aa  42.4  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.83924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>