48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3597 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3597  PEGA domain protein  100 
 
 
727 aa  1484    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.956327  normal  0.0137452 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1891  PEGA domain protein  26.38 
 
 
460 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0214  hypothetical protein  30.28 
 
 
435 aa  118  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3001  PEGA  28.12 
 
 
600 aa  117  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.221901  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2495  PEGA  26.48 
 
 
436 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.441491  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1516  PEGA domain-containing protein  26.94 
 
 
432 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0463  PEGA domain-containing protein  26.35 
 
 
497 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00383577 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  22.43 
 
 
684 aa  94  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0195  PEGA domain protein  29.96 
 
 
412 aa  86.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2302  hypothetical protein  30.13 
 
 
271 aa  84.7  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.1 
 
 
1085 aa  75.5  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.446766  hitchhiker  0.000357529 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1237  PEGA domain protein  21.72 
 
 
613 aa  73.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  26.7 
 
 
963 aa  72.4  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0086  PEGA domain-containing protein  27.2 
 
 
456 aa  72  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00061684  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0086  PEGA domain-containing protein  27.2 
 
 
456 aa  71.2  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.943488  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0814  PEGA domain-containing protein  30.82 
 
 
341 aa  70.1  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2682  serine/threonine protein kinase  25.31 
 
 
752 aa  69.3  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3131  peptidase C1A, papain  27.71 
 
 
1096 aa  69.3  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.34084  hitchhiker  0.000341484 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  23.86 
 
 
561 aa  68.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0105  PEGA domain-containing protein  28.45 
 
 
426 aa  67.8  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.192427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0111  PEGA domain protein  31.13 
 
 
416 aa  65.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  24.23 
 
 
750 aa  64.7  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0951  PEGA domain-containing protein  27.39 
 
 
409 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.919574  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1431  PEGA domain-containing protein  28.83 
 
 
326 aa  61.6  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.075762  decreased coverage  0.0000710587 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1197  PEGA domain-containing protein  44.74 
 
 
364 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.258799  hitchhiker  0.00873035 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2758  hypothetical protein  23.25 
 
 
546 aa  56.6  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2301  hypothetical protein  29.71 
 
 
219 aa  56.2  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0772  hypothetical protein  23.77 
 
 
335 aa  55.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133586  normal  0.240825 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2300  PEGA  26.96 
 
 
311 aa  54.7  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4011  PEGA domain protein  27.46 
 
 
438 aa  54.7  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0496099  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2676  serine/threonine protein kinase  27.57 
 
 
769 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.396186  normal  0.282843 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0134  hypothetical protein  26.9 
 
 
412 aa  50.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1562  PEGA domain protein  28.37 
 
 
533 aa  49.7  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00305043  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0335  PEGA domain-containing protein  34.52 
 
 
226 aa  48.9  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.250478  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03503  Secreted protein with uncharacterized domain  23.77 
 
 
660 aa  48.1  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3461  serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 
1014 aa  47.8  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445982  normal  0.215127 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0772  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 
307 aa  47.8  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.83924 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0016  hypothetical protein  20 
 
 
553 aa  47.8  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.697123  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1453  PEGA domain-containing protein  34.21 
 
 
276 aa  47  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0637995  normal  0.0741839 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0483  PEGA  42.86 
 
 
118 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6819  PEGA domain protein  33.33 
 
 
410 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.914138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0116  PEGA domain-containing protein  35 
 
 
310 aa  46.6  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0068  hypothetical protein  21.9 
 
 
394 aa  45.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000118188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0079  PEGA domain-containing protein  40 
 
 
247 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1548  hypothetical protein  26.43 
 
 
300 aa  44.7  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.199847  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2153  hypothetical protein  28.05 
 
 
581 aa  44.7  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0263882  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2317  PEGA domain-containing protein  32.18 
 
 
379 aa  44.3  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  21.72 
 
 
1189 aa  44.7  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>