More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0165 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  100 
 
 		 605 aa  1255    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0821  hypothetical protein  43.32 
 
 		 624 aa  520  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0167  hypothetical protein  36.13 
 
 		 379 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000240644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1497  NirV precursor  33.66 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0186201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  32.46 
 
 		 291 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0887  hypothetical protein  37.5 
 
 		 240 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  31.73 
 
 		 292 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  28.57 
 
 		 549 aa  127  7e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  28.57 
 
 		 600 aa  126  9e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  35.78 
 
 		 433 aa  125  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  34.63 
 
 		 586 aa  125  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  32.7 
 
 		 277 aa  121  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  29.58 
 
 		 556 aa  122  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  41.42 
 
 		 751 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  33.08 
 
 		 348 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  28.95 
 
 		 628 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  34.98 
 
 		 517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  33.08 
 
 		 348 aa  118  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  36.76 
 
 		 616 aa  117  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  37.36 
 
 		 413 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  32.32 
 
 		 570 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  34.17 
 
 		 654 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  34.17 
 
 		 657 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  33.59 
 
 		 826 aa  115  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  30.93 
 
 		 338 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  30.83 
 
 		 586 aa  112  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.83 
 
 		 390 aa  110  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  36.19 
 
 		 319 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  34.45 
 
 		 292 aa  110  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  31.75 
 
 		 535 aa  109  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  31.42 
 
 		 398 aa  108  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  34.09 
 
 		 337 aa  106  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  33.74 
 
 		 325 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  34.33 
 
 		 517 aa  105  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  31.03 
 
 		 284 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  33.78 
 
 		 491 aa  104  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  30.37 
 
 		 292 aa  104  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  28.99 
 
 		 301 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  30.65 
 
 		 283 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  31.42 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  33.05 
 
 		 300 aa  100  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  34.02 
 
 		 334 aa  99.8  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  37.88 
 
 		 307 aa  100  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  30.92 
 
 		 829 aa  99.4  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  36.23 
 
 		 742 aa  98.6  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  32.71 
 
 		 551 aa  98.2  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  32.26 
 
 		 603 aa  98.2  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1278  hypothetical protein  29.71 
 
 		 291 aa  97.4  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.633716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  32.66 
 
 		 390 aa  97.4  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  33.62 
 
 		 301 aa  97.1  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  34.86 
 
 		 820 aa  97.1  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  37 
 
 		 294 aa  97.1  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2454  protein of unknown function DUF323  32.5 
 
 		 1132 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0264144 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  35.06 
 
 		 299 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  32.03 
 
 		 352 aa  96.3  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  31.2 
 
 		 259 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  25.79 
 
 		 692 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  32.22 
 
 		 375 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  34.39 
 
 		 304 aa  95.5  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  33.53 
 
 		 416 aa  95.1  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 		 637 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  29.59 
 
 		 497 aa  94.7  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  30.57 
 
 		 862 aa  94.7  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  35.68 
 
 		 327 aa  94.7  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  28.51 
 
 		 611 aa  94  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  33.91 
 
 		 308 aa  93.2  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  36.87 
 
 		 325 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  31.82 
 
 		 409 aa  92.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  33.2 
 
 		 287 aa  92.4  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  36 
 
 		 290 aa  92  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  36 
 
 		 290 aa  92  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  36 
 
 		 290 aa  92  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  36.18 
 
 		 324 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  28.21 
 
 		 286 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 		 882 aa  91.7  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  30.22 
 
 		 267 aa  91.3  5e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2788  hypothetical protein  31.84 
 
 		 446 aa  91.3  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  31.31 
 
 		 1911 aa  90.9  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  33.06 
 
 		 421 aa  90.5  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  34.29 
 
 		 636 aa  90.5  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  33.06 
 
 		 377 aa  90.5  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  30.47 
 
 		 351 aa  90.1  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  33.04 
 
 		 331 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  35.9 
 
 		 332 aa  90.1  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  35.48 
 
 		 319 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.82 
 
 		 303 aa  90.1  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.5 
 
 		 308 aa  90.1  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  33.19 
 
 		 311 aa  89.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  32.05 
 
 		 319 aa  90.1  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  27.41 
 
 		 246 aa  90.1  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  28.33 
 
 		 384 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  30.4 
 
 		 303 aa  89  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  33.8 
 
 		 337 aa  89  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  26.91 
 
 		 358 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  34.93 
 
 		 324 aa  89.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  37.57 
 
 		 263 aa  89.7  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  28.7 
 
 		 538 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  27.17 
 
 		 282 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  31 
 
 		 523 aa  89  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  28.29 
 
 		 925 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>