More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5135 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_5135  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
324 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0556934  normal  0.285796 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5119  protein of unknown function DUF323  70.51 
 
 
322 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3787  hypothetical protein  66.88 
 
 
319 aa  438  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.293609  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8069  protein of unknown function DUF323  68.32 
 
 
324 aa  425  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3121  protein of unknown function DUF323  64.87 
 
 
334 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2985  hypothetical protein  68.32 
 
 
341 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.264968  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6750  hypothetical protein  67.22 
 
 
307 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.198292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1197  hypothetical protein  66.67 
 
 
325 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0527  hypothetical protein  61.83 
 
 
325 aa  392  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.537423  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2474  hypothetical protein  63.84 
 
 
310 aa  389  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0536  hypothetical protein  63.34 
 
 
315 aa  385  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.314703  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1048  hypothetical protein  63.82 
 
 
304 aa  378  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679488  normal  0.0129984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0792  hypothetical protein  61.97 
 
 
327 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0847186  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6898  protein of unknown function DUF323  60.6 
 
 
301 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4691  hypothetical protein  58.75 
 
 
306 aa  361  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.587755  normal  0.808045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4239  hypothetical protein  57.83 
 
 
332 aa  355  3.9999999999999996e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.779808  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2623  sulfatase-modifying factor 1  60.66 
 
 
317 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.176119  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4639  hypothetical protein  55.45 
 
 
295 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0221265  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4780  protein of unknown function DUF323  52.75 
 
 
337 aa  315  7e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.508797  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3137  hypothetical protein  55.3 
 
 
311 aa  315  8e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2936  hypothetical protein  53.35 
 
 
308 aa  314  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00394547  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4346  hypothetical protein  54.1 
 
 
291 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.229381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3066  protein of unknown function DUF323  54.64 
 
 
300 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4115  hypothetical protein  53.77 
 
 
291 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4190  hypothetical protein  53.77 
 
 
291 aa  292  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0811  protein of unknown function DUF323  54.97 
 
 
299 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2094  protein of unknown function DUF323  58.75 
 
 
306 aa  290  3e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0689999  normal  0.923316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1024  hypothetical protein  53.31 
 
 
290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000193215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1041  hypothetical protein  53.31 
 
 
290 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000747209  normal  0.145038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1053  hypothetical protein  52.98 
 
 
290 aa  281  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.354672  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0112  hypothetical protein  50.99 
 
 
331 aa  279  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.379229  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0760  protein of unknown function DUF323  48.93 
 
 
329 aa  278  7e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10726  hypothetical protein  51.99 
 
 
299 aa  276  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.374727 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1204  protein of unknown function DUF323  48.03 
 
 
330 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.578332 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2681  hypothetical protein  50.65 
 
 
337 aa  270  2e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0932  protein of unknown function DUF323  48.4 
 
 
338 aa  269  4e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5038  hypothetical protein  52.82 
 
 
294 aa  267  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00125296  normal  0.382388 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0378  Non-specific serine/threonine protein kinase  44.97 
 
 
367 aa  265  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2206  hypothetical protein  46.2 
 
 
384 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.358148  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2134  hypothetical protein  47.63 
 
 
384 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00361005 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2673  hypothetical protein  47.71 
 
 
351 aa  259  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1319  hypothetical protein  52.33 
 
 
290 aa  259  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.162258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  45.37 
 
 
409 aa  258  9e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2052  hypothetical protein  48.68 
 
 
336 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.716494  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4529  Sulfatase-modifying factor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme) DUF323  46.06 
 
 
408 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126312  normal  0.048963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3353  hypothetical protein  48.84 
 
 
291 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.841057  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2405  hypothetical protein  47.95 
 
 
341 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04261  hypothetical protein  48.14 
 
 
287 aa  255  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3179  protein of unknown function DUF323  44.81 
 
 
351 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4568  hypothetical protein  46.06 
 
 
390 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0138107  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5651  hypothetical protein  45.25 
 
 
421 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.191588 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5208  hypothetical protein  45.25 
 
 
377 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1433  protein of unknown function DUF323  45.03 
 
 
358 aa  246  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5096  protein of unknown function DUF323  47.48 
 
 
375 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397537  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1837  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.73 
 
 
349 aa  242  7.999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26230  hypothetical protein  45.4 
 
 
312 aa  236  4e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1132  hypothetical protein  45.36 
 
 
318 aa  229  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4811  Non-specific serine/threonine protein kinase  45.19 
 
 
303 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3062  Non-specific serine/threonine protein kinase  41.35 
 
 
308 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.349109 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05880  hypothetical protein  41.38 
 
 
303 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.505302  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1714  hypothetical protein  40.59 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0300  hypothetical protein  40.07 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  38.74 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4473  protein of unknown function DUF323  39.81 
 
 
361 aa  193  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5129  hypothetical protein  39.48 
 
 
347 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.133982 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5422  Sulfatase-modifying factor 1 precursor (C-alpha-formyglycine- generating enzyme 1); putative exported protein  38.44 
 
 
352 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3975  hypothetical protein  39.16 
 
 
349 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0491095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3544  hypothetical protein  39.16 
 
 
349 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.915996  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0111  Non-specific serine/threonine protein kinase  39.55 
 
 
319 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.119305  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3455  hypothetical protein  38.83 
 
 
349 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5277  hypothetical protein  38.83 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2583  hypothetical protein  38.83 
 
 
349 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0229  protein of unknown function DUF323  40.62 
 
 
351 aa  179  5.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3335  protein of unknown function DUF323  40.61 
 
 
259 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3264  hypothetical protein  37.19 
 
 
330 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2027  hypothetical protein  33.03 
 
 
314 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.883912  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  33.7 
 
 
751 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  32.91 
 
 
433 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  31.94 
 
 
742 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  34.6 
 
 
325 aa  117  3e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  32.58 
 
 
826 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  30.74 
 
 
586 aa  110  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1702  hypothetical protein  31.49 
 
 
510 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  31.39 
 
 
517 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1513  hypothetical protein  31.07 
 
 
369 aa  106  6e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.973271 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  29.45 
 
 
517 aa  105  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0422  hypothetical protein  30.36 
 
 
614 aa  105  1e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.385064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  29.38 
 
 
829 aa  103  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  34.93 
 
 
605 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2222  serine/threonine protein kinase  30.84 
 
 
1818 aa  99.4  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.943108  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  30.93 
 
 
1911 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1976  protein of unknown function DUF323  29.28 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.300253  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4245  protein of unknown function DUF323  33.48 
 
 
259 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.275771  normal  0.877296 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  31.62 
 
 
338 aa  94  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  31.94 
 
 
437 aa  94.4  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  32.78 
 
 
348 aa  93.6  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  29.32 
 
 
628 aa  94  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  28.75 
 
 
549 aa  93.6  4e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  28.75 
 
 
600 aa  93.2  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  32.45 
 
 
348 aa  92.8  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>